包含使用修饰的单糖化合物的用于特异性标记活菌的方法

摘要

本发明涉及在包含细菌的样品中特异性标记给定类别的革兰氏阴性菌的活菌的方法，所述方法包括步骤：a)将所述样品的所述细菌与至少一种修饰的单糖化合物孵育，所述单糖化合物包含能够与第二反应基团反应的第一反应化学基团，以使带有所述第一反应基团的单糖残基被合并入该细菌的外膜的多糖中，和b)将所述合并入细菌外膜中的修饰的单糖残基与包含所述第二反应基团的标记分子接触。所述修饰的单糖化合物为具有下式(I)的化合物或其盐：其中X可以为O、NH或S，R1、R2和R3可以独立地为H、OH、NH₂、被或不被其保护基取代的OH和NH₂，和R4为H或C₁至C₄的烷基链，每个碳被或不被OH或NH₂取代，所述OH或NH₂被或不被其保护基取代，和X、R1、R2、R3和R4基团中的至少一个被所述第一反应基团R’1取代。

主权项

一种在包含细菌的样品中特异性标记给定类别的细菌的活菌的方法，所述方法包括步骤：a)将所述样品的所述细菌与至少一种修饰的单糖化合物孵育，所述单糖化合物包含能够与第二反应基团化学性反应的第一反应化学基团，以使带有所述第一反应基团的单糖残基被合并入该细菌的外膜的多糖中，尤其是被合并入该细菌的外膜的LPS或CPS中，和b)将所述合并入细菌外膜中的修饰的单糖残基与包含所述第二反应基团的标记分子接触，以产生被合并入所述活菌的所述外膜中的所述单糖残基的所述第一反应基团与所述标记分子的所述第二反应基团的化学反应，导致共价连接，其特征在于，所述修饰的单糖化合物为所述细菌的所述外膜的多糖的内源性酮糖酸残基的修饰的内源性前体，所述修饰的单糖化合物具有下式(I)或其盐：其中‑X可以为O、NH或S，优选O和NH，更优选O，和‑R1、R2和R3可以独立地为H、OH、NH₂、被或不被其保护基取代的OH和NH₂，优选被烷基、羟基烷基、酰基、甲酰基或亚胺酰基取代，和‑R4为H或C₁至C₄的烷基链，每个碳被或不被OH或NH₂取代，所述OH或NH₂被或不被其保护基取代，优选被烷基、羟基烷基、酰基、甲酰基或亚胺酰基取代，和‑X、R1、R2、R3和R4基团中的至少一个被所述第一反应基团取代。