| 摘要 |
1. Способ поиска новых потенциальных маркеров злокачественных опухолей человека на основе анализа баз данных EST, включающий следующие этапы: ! а) определение набора клонотек EST с высоким содержанием клонов EST для пары тканей (норма и опухоль); ! б) нормирование уровня мРНК изучаемых генов, определяемого по количеству соответствующих клонов EST в клонотеке; ! в) определение генов со стабильным уровнем транскрипции в норме или опухоли; ! г) определение генов со стабильно измененным уровнем транскрипции в опухоли по сравнению с нормой. ! 2. Способ по п.1, где на этапе а) используют только EST, содержащих невысокий процент мутаций и повторяющихся элементов. ! 3. Способ по п.1, где на этапе а) используют только EST, содержащих границу сплайсинга. ! 4. Способ по п.1, где на этапе б) в рамках каждой клонотеки проводят предварительное нормирование количеств EST для каждого гена по среднему степенному количеству EST, соответствующих предварительно известным контрольным генам. ! 5. Способ по п.1, где на этапе б) осуществляют исключение из анализа клонотек с низким содержанием EST для контрольных генов. ! 6. Способ по п.1, где на этапе б) проводят построение скоринг-функции S, представляющей собой произведение шести отдельных компонентов и отражающей степень пригодности рассматриваемого гена в качестве контрольного, и осуществляют отбор генов с наибольшими значениями скоринг-функции в качестве контрольных генов, в том числе дополнительных, компоненты скоринг-функции выражают собой: ! а) долю клонотек, в которых присутствуют EST, соответствующие рассматриваемому гену; ! б) средний уровень транскрипции гена по всем клонотекам; ! в) стабильность уровня тр� |
