发明名称 一种样本组合分析核酸序列的方法
摘要 本发明提供了一种基于样本组合分析核酸序列的方法。通过将需要分析的多个样本按照特定的组合方式分成若干组,并确保每个样本在不同的y组(y≧2)、且仅为y组中被分析y次,然后每个组按照一个分析样品实施对核酸序列分析,最后根据若干组样品的分析结果,组合判断具体样本的分析结果。该方法针对单个指标的特征核酸片段序列,且在多样本中只有极少数样本具有该特征核酸片段序列,其目的是利用组合方式,通过对远小于样本数的样品实施分析,确定具有该特征核酸片段序列的样本。该方法可以显著提高大样本的分析效率、大幅度降低分析成本。
申请公布号 CN105678110A 申请公布日期 2016.06.15
申请号 CN201610060973.3 申请日期 2016.01.29
申请人 东南大学 发明人 肖鹏峰;孙啸
分类号 G06F19/22(2011.01)I 主分类号 G06F19/22(2011.01)I
代理机构 江苏永衡昭辉律师事务所 32250 代理人 王斌
主权项 一种基于样本组合分析核酸序列的方法,其特征在于,将需要分析的N个样本(N﹥3)按照特定的样品组合方式分成M组,然后每组按照一个分析样品实施对特征核酸序列片段分析,含有特征核酸序列片段为阳性、不含有特征核酸序列片段为阴性,最后根据M组样品的分析结果,组合判断N个样本中每个具体样本的分析结果,包括如下步骤 :a. N个样本的分组,即:样本分组的数目M通过分析的样本数N、每个样本被分析的次数y来确定的(y≥2),组数M与N、y的关系满足:[M(M‑1) (M‑2)…(M‑y)]/[y(y‑1)(y‑2)…×2×1≦N,对每个样本设唯一编号,对每组样品设唯一的编号、由若干不同样本等量混匀组成,在选定分析方法的检测限内,每组样品包含的样本数最多为yN/M、最少为1,使得同一样本必须分在不同的y组、且只能分在不同的y个组中,即所有样本均需在不同的y组样品中被分析y次;b. 对每组混合样品进行分析;c.确定每个样本的信息,每个样本的信息是指根据M组样品得到M个分析结果按照如下方法进行确定:c‑1. M个分析结果无一组样品为阳性结果:N个样本均为阴性;c‑2. M个分析结果中有y组样品为阳性结果:则N个样本中只有有1个阳性标本,其具体样本编号为样品阳性信息的y组所共有的样本编号;c‑3. M个分析结果中有P(y≤P≤M)组样品为阳性结果:N个样本中有(P‑1)个阳性,其具体样本通过阳性信号两组的共有样本编号找出(P‑1)+(P‑2)+(P‑3)+…+3+2+1个可能的样本。
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