发明名称 一种检测细胞NF-κB信号通路的PCR试剂及其应用
摘要 本发明提供了一种检测细胞NF‑κB信号通路的PCR试剂及其应用,本发明所述检测试剂包括检测CD40基因、IL10基因、CD83基因、EGFR基因等相关基因和内参ACTB基因、GAPDH基因、HPRT1基因的PCR反应引物。本发明将涉及NF‑κB信号分子集中在一个平板上,通过做一次实时荧光定量PCR反应,反应细胞的生存状态,与正常的肝癌、肝细胞做对比,探讨NF‑κB信号通路在肿瘤/正常细胞中的可能途径,为研究关键蛋白的调控提供最直接的证据;本发明从转录水平快速准确的找到NF‑κB信号通路相关分子,为抗癌药物筛选、新靶向药物的机制探讨等提供了有力的工具。
申请公布号 CN104450886B 申请公布日期 2016.08.24
申请号 CN201410608428.4 申请日期 2014.11.03
申请人 青岛大学附属医院 发明人 刘世海;梁军;潘华政;王丽萍;刘相萍;梁晔;姚如永;隋爱华;刘自民
分类号 C12Q1/68(2006.01)I 主分类号 C12Q1/68(2006.01)I
代理机构 青岛致嘉知识产权代理事务所(普通合伙) 37236 代理人 王晓晓
主权项 一种检测细胞NF‑κB信号通路的PCR试剂,其特征在于它包括以下引物:(1)检测CD40基因的PCR反应引物,其引物序列如下:5'‑TGGGGTCAAGCAGATTGCTA‑3';5'‑CAGATGACACATTGGAGAAGA‑3';(2)检测IL 10基因的PCR反应引物,其引物序列如下:5'‑CAAGGCGCATGTGAACTCC‑3';5'‑ATGTCAAACTCACTCATGGCT‑3';(3)检测CD83基因的PCR反应引物,其引物序列如下:5'‑AAGCTGGCATGGAACGAG‑3';5'‑GTCTTGTGAGGAGTCACTAGC‑3';(4)检测EGFR基因的的PCR反应引物,其引物序列如下:5'‑GGCACGAGTAACAAGCTCAC‑3';5'‑TGAGGACATAACCAGCCACC‑3';(5)检测FASLG基因的的PCR反应引物,其引物序列如下:5'‑TTTAACAGGCAAGTCCAACTCA‑3';5'‑GCCACCCTTCTTATACTTCACT‑3';(6)检测IL 1A基因的的PCR反应引物,其引物序列如下:5'‑TCATGTAAGCTATGGCCCACT‑3';5'‑TTCCCGTTGGTTGCTACTAC‑3';(7)检测IL 1B基因的的PCR反应引物,其引物序列如下:5'‑TCGACACATGGGATAACGAGG‑3';5'‑TTTTGCTGTGAGTCCCGGAG‑3';(8)检测IL 1R1基因的的PCR反应引物,其引物序列如下:5'‑GCCAGTTGAGTGACATTGCT‑3';5'‑GTGATGAGGGTACTCCTTCTTT‑3';(9)检测IL8基因的的PCR反应引物,其引物序列如下:5'‑CTGAGAGTGATTGAGAGTGGAC‑3';5'‑ACCCTCTGCACCCAGTTTTC‑3';(10)检测LTBR基因的的PCR反应引物,其引物序列如下:5'‑CAGTCCGACACAACCTGC‑3';5'‑TACAGGATTGGGTCCCTCTC‑3';(11)检测NOD 1基因的的PCR反应引物,其引物序列如下:5'‑GCGACCACGTCCTGCTAT‑3';5'‑AGGTTGGTGAACTGGAAGTG‑3';(12)检测TLR1基因的PCR反应引物,其引物序列如下:5'‑TCAAACGTGAAGCTACAGGG‑3';5'‑CGAACACATCGCTGACAACT‑3';(13)检测TLR2基因的PCR反应引物,其引物序列如下:5'‑CTCTCGGTGTCGGAATGTC‑3';5'‑CCCGCTCACTGTAAGAAACA‑3';(14)检测TLR3基因的PCR反应引物,其引物序列如下:5'‑AAACACAAGCATTCGGAATCTG‑3';5'‑AGGAATCGTTACCAACCACATT‑3';(15)检测TLR4基因的PCR反应引物,其引物序列如下:5'‑GTTGATCTACCAAGCCTTGAGT‑3';5'‑CTGGTTGTCCCAAAATCACTTT‑3';(16)检测TLR6基因的PCR反应引物,其引物序列如下:5'‑GAATGCAAAAACCCTTCACCT‑3';5'‑CAAGTCGTTTCTATGTGGTTGA‑3';(17)检测TLR9基因的PCR反应引物,其引物序列如下:5'‑ATCCCTCATATCCCTGTCCC‑3';5'‑TTGCCGTCCATGAATAGGAAG‑3';(18)检测TNF基因的PCR反应引物,其引物序列如下:5'‑AGGCCAAGCCCTGGTATG‑3';5'‑AGGCCAAGCCCTGGTATG‑3';(19)检测TNFRSF 1A基因的PCR反应引物,其引物序列如下:5'‑ACGAGTGTGTCTCCTGTAGT‑3';5'‑GAGTAGAGCTTGGACTTCCAC‑3';(20)检测TNFRSF 10A基因的PCR反应引物,其引物序列如下:5'‑CGGGGAGGATTGAACCAC‑3';5'‑GACGACAAACTTGAAGGTCTT‑3';(21)检测TNFRSF 10B基因的PCR反应引物,其引物序列如下:5'‑CAGTTGCAGCCGTAGTCTTG‑3';5'‑CAGGTCGTTGTGAGCTTCT‑3';(22)检测TNF SF 10基因的PCR反应引物,其引物序列如下:5'‑GCGTGCTGATCGTGATCTTC‑3';5'‑CTCGTTGGTAAAGTACACGTA‑3';(23)检测BIRC2基因的PCR反应引物,其引物序列如下:5'‑TTCAGTGGTTCTTACTCCAGC‑3';5'‑CTGTAGGGGTTAGTCCTCGAT‑3';(24)检测FADD基因的PCR反应引物,其引物序列如下:5'‑GAGAAGGAGAACGCAACAGT‑3';5'‑CTGAACCTCTTGTACCAGGTC‑3';(25)检测IRAK 1基因的PCR反应引物,其引物序列如下:5'‑GGTTTCGTCACCCAAACATT‑3';5'‑GGGCTGTACCCAGAAGGA‑3';(26)检测IRAK2基因的PCR反应引物,其引物序列如下:5'‑TGCCACCCCAATGTCTTACC‑3';5'‑GGGAACCATTTGCCATGTAG‑3';(27)检测IRF 1基因的PCR反应引物,其引物序列如下:5'‑CAGCTACACAGTTCCAGG‑3';5'‑TCCTCAGGTAATTTCCCTTCCT‑3';(28)检测MYD88基因的PCR反应引物,其引物序列如下:5'‑GCTGCTCTCAACATGCGA‑3';5'‑TGTGTCCGCACGTTCAAGA‑3';(29)检测RIPK 1基因的PCR反应引物,其引物序列如下:5'‑TACATGGAAAAGGCGTGATACA‑3';5'‑GGTCTGCGATCTTAATGTGGA‑3';(30)检测TBK 1基因的PCR反应引物,其引物序列如下:5'‑GATCACTGCCATTTAGACCC‑3';5'‑AGGCATGTCTCCACTCCAG‑3';(31)检测TICAM1基因的PCR反应引物,其引物序列如下:5'‑CTGGAATCATCATCGGAACAG‑3';5'‑GAGTGGTCTATGGCGTCCT‑3';(32)检测TNFAIP3基因的PCR反应引物,其引物序列如下:5'‑CAACTGGTGTCGAGAAGTCC‑3';5'‑AAGTCTGTGTCCTGAACGC‑3';(33)检测TRADD基因的PCR反应引物,其引物序列如下:5'‑CTGTTTGAGTTGCATCCTAGC‑3';5'‑CGCACTTCAGATTTCGCA‑3';(34)检测TRAF2基因的PCR反应引物,其引物序列如下:5'‑CTCATGCTGACCGAATGTC‑3';5'‑CCGTCACAAGTTAAGGGGAA‑3';(35)检测TRAF3基因的PCR反应引物,其引物序列如下:5'‑CTTGAGGAAAGACCTGCGAG‑3';5'‑CGATCATCGGAACCTGACT‑3';(36)检测TRAF6基因的PCR反应引物,其引物序列如下:5'‑TGCCATGAAAAGATGCAGAGG‑3';5'‑GCCTGGGCCAACATTCTC‑3';(37)检测BCL3基因的PCR反应引物,其引物序列如下:5'‑ACATCTACAACAACCTACGGC‑3';5'‑GTGAGCCCGTCATAATTGC‑3';(38)检测CHUK基因的PCR反应引物,其引物序列如下:5'‑TGAAGAAGTTGAACCATGCCA‑3';5'‑CTCCAGAACAGTATTCCATTGC‑3';(39)检测IKBKB基因的PCR反应引物,其引物序列如下:5'‑TGGCCTTTGAGTGCATCAC‑3';5'‑GCTAACAACAATGTCCACCT‑3';(40)检测IKBKG基因的PCR反应引物,其引物序列如下:5'‑GGCAGAGCAACCAGATTCT‑3';5'‑CTGGCATTCCTTAGTGGCAG‑3';(41)检测NFKBIA基因的PCR反应引物,其引物序列如下:5'‑TCCGAGACTTTCGAGGAAATAC‑3';5'‑CCATTGTAGTTGGTAGCCTTCA‑3';(42)检测NFKBIE基因的PCR反应引物,其引物序列如下:5'‑AATTGCTGCTTCGGAATGGA‑3';5'‑ATGCGGGCATCTACCTGG‑3';(43)检测NFKB 1基因的PCR反应引物,其引物序列如下:5'‑AAGCACGAATGACAGAGGC‑3';5'‑CTTGGCGGATTAGCTCTTTT‑3';(44)检测NFKB2基因的PCR反应引物,其引物序列如下:5'‑TGGAGAGTTGCTACAACCCA‑3';5'‑TGTTCCACGATCACCAGGTA‑3';(45)检测REL基因的PCR反应引物,其引物序列如下:5'‑CATGGTAATTTGACGACTGCT‑3';5'‑CTTCCCAATCGTTCAACACA‑3';(46)检测RELA基因的PCR反应引物,其引物序列如下:5'‑TGGGGACTACGACCTGAATG‑3';5'‑GGGCACGATTGTCAAAGATG‑3';(47)检测RELB基因的PCR反应引物,其引物序列如下:5'‑TCCGAGCCCGTCTATGACAA‑3';5'‑GTCTTGAACACAATGGCAATC‑3';(48)检测CCL2基因的PCR反应引物,其引物序列如下:5'‑AGCCAGATGCAATCAATGCC‑3';5'‑GGAATCCTGAACCCACTTCT‑3';(49)检测CCL5基因的PCR反应引物,其引物序列如下:5'‑CAGCAGTCGTCTTTGTCAC‑3';5'‑TCTGGGTTGGCACACACTT‑3';(50)检测C SF 1基因的PCR反应引物,其引物序列如下:5'‑GACCTCGTGCCAAATTACATT‑3';5'‑GGTGTCTCATAGAAAGTTCGGA‑3';(51)检测C SF2基因的PCR反应引物,其引物序列如下:5'‑CCTGAACCTGAGTAGAGACAC‑3';5'‑GCTGCTTGTAGTGGCTGG‑3';(52)检测C SF3基因的PCR反应引物,其引物序列如下:5'‑CTGCTTGAGCCAACTCCATA‑3';5'‑AACGCGGTACGACACCTC‑3';(53)检测ICAM 1基因的PCR反应引物,其引物序列如下:5'‑TATGAACTGAGCAATGTGCAAG‑3';5'‑TTCCACCCGTTCTGGAGTC‑3';(54)检测IFNA 1基因的PCR反应引物,其引物序列如下:5'‑CCTCGCCCTTTGCTTTACT‑3';5'‑TGTGGGTCTCAGGGAGATCA‑3';(55)检测IFNG基因的PCR反应引物,其引物序列如下:5'‑CGGTAACTGACTTGAATGTCCA‑3';5'‑CGCTTCCCTGTTTTAGCTGC‑3';(56)检测TIMP1基因的PCR反应引物,其引物序列如下:5'‑CCACCTTATACCAGCGTTATGA‑3';5'‑GTGTAGACGAACCGGATGTC‑3';(57)检测LTA基因的PCR反应引物,其引物序列如下:5'‑ATCTACTTCGTCTACTCCCAGG‑3';5'‑CCCGTGGTACATCGAGTG‑3';(58)检测BIRC3基因的PCR反应引物,其引物序列如下:5'‑CCATTGACTTTTCTGTCGCC‑3';5'‑CAAAGCAAGCCACTCTGT‑3';(59)检测AGT基因的PCR反应引物,其引物序列如下:5'‑TCCAATTCAGGCCAAGACAT‑3';5'‑GTCAAGTTTTGCAGCGACTA‑3';(60)检测BCL2A 1基因的PCR反应引物,其引物序列如下:5'‑GTGCTACAAAATGTTGCGTTC‑3';5'‑GCAATTTGCTGTCGTAGAAGTT‑3';(61)检测BCL2L 1基因的PCR反应引物,其引物序列如下:5'‑ACTGAATCGGAGATGGAGACC‑3';5'‑CAGTTCAAACTCGTCGCCT‑3';(62)检测BIRC3基因的PCR反应引物,其引物序列如下:5'‑CCATTGACTTTTCTGTCGCC‑3';5'‑CAAAGCAAGCCACTCTGT‑3';(63)检测AKT 1基因的PCR反应引物,其引物序列如下:5'‑ACAAACGAGGGGAGTACATC‑3';5'‑CCATCATTCTTGAGGAGGAAGT‑3';(64)检测MAP3K 1基因的PCR反应引物,其引物序列如下:5'‑TAGGGCCTAACTCTTTCCTGAT‑3';5'‑GTTCTAGTTGAAACACCCGGA‑3';(65)检测RAF 1基因的PCR反应引物,其引物序列如下:5'‑GTTCAGCAGTTTGGCTATCAG‑3';5'‑ACTGTTCTTTGCTTGTTCGG‑3';(66)检测ATF 1基因的PCR反应引物,其引物序列如下:5'‑ACAGATGGAGTACAGGGACT‑3';5'‑ACCACCTGATTGCTGGGC‑3';(67)检测EGR1基因的PCR反应引物,其引物序列如下:5'‑CCCCTCTGTCTACTATTAAGGC‑3';5'‑GGGACTGGTAGCTGGTATTG‑3';(68)检测ELK 1基因的PCR反应引物,其引物序列如下:5'‑ATCGGAAGAGCTTAATGTGGAG‑3';5'‑TTGGTGGTTTCTGGCACAA‑3';(69)检测FO S基因的PCR反应引物,其引物序列如下:5'‑ACTCCAAGCGGAGACAGAC‑3';5'‑GGTCATCAGGGATCTTGCAG‑3';(70)检测JUN基因的PCR反应引物,其引物序列如下:5'‑CCAAGTGCCGAAAAAGGAAG‑3';5'‑GAGTTCTGAGCTTTCAAGGT‑3';(71)检测STAT 1基因的PCR反应引物,其引物序列如下:5'‑GGCTGAATTTCGGCACCT‑3';5'‑AGTAACGATGAGAGGACCCT‑3';(72)检测CARD 11基因的PCR反应引物,其引物序列如下:5'‑ACCTTCCAGGAGCGGTACTA‑3';5'‑TAGCGCATGGCTAAGTTGTA‑3';(73)检测CASP 1基因的PCR反应引物,其引物序列如下:5'‑CCAATAATGGACAAGTCAAGCC‑3';5'‑CTGTACCCCAGATTTTGTAGCA‑3';(74)检测CASP8基因的PCR反应引物,其引物序列如下:5'‑TCATGGACCACAGTAACATGGA‑3';5'‑AGTGAACTGAGATGTCAGCTCAT‑3';(75)检测CFLAR基因的PCR反应引物,其引物序列如下:5'‑GAGTGAGGCGATTTGACCTG‑3';5'‑TCCGAAACAAGGTGAGGGTT‑3';(76)检测HMOX1基因的PCR反应引物,其引物序列如下:5'‑AGACTGCGTTCCTGCTCAAC‑3';5'‑AAGCCCTACAGCAACTGTCG‑3';(77)检测MALT 1基因的PCR反应引物,其引物序列如下:5'‑GAGAAGTGTTGATGGCGTCT‑3';5'‑TAGTGAGGAATAGGGCTTCCA‑3';(78)检测PSIP 1基因的PCR反应引物,其引物序列如下:5'‑AAACAGGGGTTACTTCAACCTC‑3';5'‑GCCTTTCAGCATATTCCTTCT‑3';(79)检测RHOA基因的PCR反应引物,其引物序列如下:5'‑ATTGGCGCTTTTGGGTACAT‑3';5'‑GCAGCTCTCGTAGCCATTTC‑3';(80)检测CCL20基因的PCR反应引物,其引物序列如下:5'‑GCTGTACCAAGAGTTTGCTC‑3';5'‑GCACACAGACAACTTTTTCTTT‑3';(81)检测CXCL2基因的PCR反应引物,其引物序列如下:5'‑CATCGCCCATGGTTAAGAAAAT‑3';5'‑ATTGGTGGCTGTTCCTGAAGGA‑3';(82)检测CXCL3基因的PCR反应引物,其引物序列如下:5'‑CAAACCGAAGTCATAGCCAC‑3';5'‑GCTCCCCTTGTTCAGTATCT‑3';(83)检测STX11基因的PCR反应引物,其引物序列如下:5'‑TAAGTGGGACGTGTTTTCCG‑3';5'‑TCGATGACGTTCAGGGTGT‑3';(84)检测TIFA基因的PCR反应引物,其引物序列如下:5'‑TACAGGTGCATGGTCAGATTCG‑3';5'‑CTGTCGGAGAACTGCTTTGG‑3';(85)检测GAPDH基因的PCR反应引物,其引物序列如下:5'‑CTGCCACCCAGAAGACT‑3';5'‑CTCAGTGTAGCCCAGGAT‑3';(86)检测ACTB基因的PCR反应引物,其引物序列如下:5'‑GCTACAGCTTCACCACCAC‑3';5'‑ACTTGCGCTCAGGAGGAGC‑3';(87)检测HPRT 1基因的PCR反应引物,其引物序列如下:5'‑AAAAGGACCCCACGAAGTGT‑3';5'‑GTCAAGGGCATATCCTACAACA‑3'。
地址 266003 山东省青岛市市南区江苏路16号