发明名称 |
超低频突变分子标签聚类分群算法 |
摘要 |
本发明公开了一种对测序读段进行聚类的方法,所述测序读段携带标签序列,该方法包括:(1)将多个测序读段与参考序列进行比对,并确定各测序读段的两端位置,将两端位置一致的测序读段归类至相同的一级群;(2)对属于同一个一级群的测序读段根据其标签序列进一步分二级群,将分子标签序列相似的测序读段分为同一个二级群。通过该方法能准确有效地对测序读段进行聚类分群,为后期通过各个群的一致性序列来精确检测低频突变奠定坚实的基础。 |
申请公布号 |
CN106021987A |
申请公布日期 |
2016.10.12 |
申请号 |
CN201610350317.7 |
申请日期 |
2016.05.24 |
申请人 |
人和未来生物科技(长沙)有限公司 |
发明人 |
曾华萍;宋卓;袁梦兮 |
分类号 |
G06F19/18(2011.01)I;G06F19/24(2011.01)I;C12Q1/68(2006.01)I |
主分类号 |
G06F19/18(2011.01)I |
代理机构 |
北京清亦华知识产权代理事务所(普通合伙) 11201 |
代理人 |
李志东 |
主权项 |
一种对测序读段进行聚类的方法,所述测序读段携带标签序列,其特征在于,所述方法包括:(1)将多个测序读段与参考序列进行比对,并确定各测序读段两端的位置,将两端位置一致的测序读段归类至相同的一级群;(2)对属于同一个一级群的测序读段根据其标签序列进一步分二级群,将分子标签序列相似的测序读段分为同一个二级群。 |
地址 |
410152 湖南省长沙市开福区青竹湖镇太阳山路湖心岛2号栋 |