发明名称 |
一种通过布尔网络模拟肿瘤细胞状态的方法 |
摘要 |
本发明实施例公开了一种通过布尔网络模拟肿瘤细胞状态的方法,该方法包括:利用基因芯片采集技术获取生物样本基因的连续表达谱数据,并根据连续表达谱数据,构建初始基因调控网络;基于预设的基因关联性对初始基因调控网络进行删减调整,得到相关基因调控网络,并通过布尔函数对相关基因调控网络进行计算,得到相关基因调控网络的单吸引子;确定初始基因调控网络中目标基因的调控范围,并将目标基因的调控范围依据相关基因调控网络的单吸引子转化为复合布尔函数的吸引子,且进一步将转化的吸引子与细胞吸引子进行匹配来确定肿瘤细胞状态。实施本发明,能够对肿瘤基因有全面的认识,快速鉴定肿瘤,为肿瘤治疗研究提供一个有力的理论框架。 |
申请公布号 |
CN106021989A |
申请公布日期 |
2016.10.12 |
申请号 |
CN201610371015.8 |
申请日期 |
2016.05.28 |
申请人 |
温州大学 |
发明人 |
刘文斌;沈良忠 |
分类号 |
G06F19/18(2011.01)I |
主分类号 |
G06F19/18(2011.01)I |
代理机构 |
温州名创知识产权代理有限公司 33258 |
代理人 |
陈加利 |
主权项 |
一种通过布尔网络模拟肿瘤细胞状态的方法,其特征在于,所述方法包括:a、利用基因芯片采集技术获取生物样本基因的连续表达谱数据,并根据所述获取到的连续表达谱数据,构建布尔网络模型的初始基因调控网络;b、基于预设的基因关联性对所述初始基因调控网络进行删减调整,得到相关基因调控网络,并通过布尔函数对所述得到的相关基因调控网络进行计算,得到所述相关基因调控网络的单吸引子;c、确定所述初始基因调控网络中目标基因的调控范围,并将所述确定的目标基因的调控范围依据所述得到的相关基因调控网络的单吸引子转化为复合布尔函数的吸引子,且进一步将所述转化的吸引子与细胞吸引子进行匹配来确定肿瘤细胞状态。 |
地址 |
325000 浙江省温州市瓯海区东方南路38号温州市国家大学科技园孵化器 |