发明名称 一种光合通路基因调控网络的构建方法
摘要 本发明提供了一种光合通路基因调控网络的构建方法,包括以下步骤:1)获得物种的光合通路基因的SNP数据;2)对物种的表型性状测定,得到表型数据;3)利用所述步骤1)得到的SNP数据和所述步骤2)得到的表型数据进行基因位点间的上位性模式检测,确定两两基因间的相互作用关系;4)验证所述步骤3)得到基因间的相关性;5)以所述步骤3)得到具有相关性的基因为候选基因,构建基因调控网络;所述步骤1)和步骤2)之间没有时间顺序限制。本发明提供的构建方法综合考虑基因位点变异及生物群体表型,通过计算位点间上位性,更精确地构建基因调控网络,并且对光合作用机理的研究及其改良具有重要的理论意义和实用价值。
申请公布号 CN106599607A 申请公布日期 2017.04.26
申请号 CN201611143308.7 申请日期 2016.12.13
申请人 北京林业大学 发明人 张德强;王龙欣;杜庆章
分类号 G06F19/12(2011.01)I 主分类号 G06F19/12(2011.01)I
代理机构 北京高沃律师事务所 11569 代理人 王加贵
主权项 一种光合通路基因调控网络的构建方法,其特征在于,包括以下步骤:1)获得物种的光合通路基因的SNP数据;2)对物种的表型性状测定,得到表型数据;3)利用所述步骤1)得到的SNP数据和所述步骤2)得到的表型数据进行基因位点间的上位性模式检测,确定两两基因间的相互作用关系;4)验证所述步骤3)得到基因间的相关性;5)以所述步骤3)得到具有相关性的基因为候选基因,构建基因调控网络;所述步骤1)和步骤2)之间没有时间顺序限制。
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