一种寡核苷酸探针及其获得方法

摘要

本发明涉及一种获得寡核苷酸探针的方法，其是从公共数据库下载农作物物种基因组序列，进行过滤后找出串联重复序列，再对初步查找到的重复序列进行筛选，然后将剩下的串联重复序列与已知的探针序列进行比对，去掉已经使用的探针序列，将筛选剩下的串联重复序列进行比对，以进行探针设计并将设计好的探针序列进行合成、验证后，获得能起作用的寡核苷酸序列。本发明成本低，效率高，能用于农作物染色体的非变性荧光原位杂交(ND‑FISH)分析，明确探针所代表的串联重复序列在染色体上的分布，了解染色体的结构特点，建立染色体特定界标，从而识别农作物特定的染色体或染色体区段，使开发的新寡核苷酸探针具有染色体或染色体区段特异性。

主权项

一种寡核苷酸探针，其特征在于，主要包括以下寡核苷酸序列：Oligo‑1AS.20:AACTTTTTTCAAATTCGATG；Oligo‑4AL.20:TGAAAAAAGTTCATCAAATT；Oligo‑6AS.4:TCGATGAACTTTTTCAAAT；Oligo‑3AS.49:GACACCGAGGCACCGTAAACCCTAATGGTTAGGTTTAGGTGGCTCCGTC；Oligo‑5BL.49:AAGTTGATGGCTTTAGGTGGTTCCGTCGACCCCGAGCCACCCTAGACCC；Oligo‑10.13.4:GGGTTTTGGTGGCTCGGGGTCGACGAAAACACCTAAAGCTATCAGTTA；Oligo‑5AL.44:TAGCTCTACAAGCTAGTTCAAATAATTTTACACTAGAGTTGAAC；Oligo3B.61:GCCTGAAAATTACAACTTTTCGACACCGCCACGTGTAAGCCCGACCCAAACA CAA CCC；Oligo‑M18s‑3:GGAGG CGCGC TGCCA CGGGC GGCAG GGCTGT TCGGC CTTGC GTTTG GGCTG AAAAC GAG；Oligo‑M74471:AGTAGC AGTAGC AGTAGC AGTAGC。