生物成像方法和系统

摘要

一种用于增强生物样品的图像的方法，生物样品已经在容器中的培养基上生长。

主权项

一种隔离包括培养基的容器中的微生物菌落的方法，其中所述容器是培养皿，所述方法包括以下步骤：‑使用多个照明源中的一个或多个获得所述容器的一个或多个图像，每个照明源能够从不同的方向照亮所述容器；‑选择图像或图像的组合以用于进一步的处理；‑应用圆形物体检测变换以识别所述容器中的一个或多个实质上圆形的物体，这些圆形物体代表所述容器中的被隔离的菌落；‑对于每个已识别的实质上圆形的物体，确定针对该物体的隔离区域，其中确定物体的隔离区域的步骤包括：‑确定所述已识别的实质上圆形的物体的中心；‑通过应用二值化步骤以获得二值化的图像来形成所述已识别的实质上圆形的物体的数字化的图像，其中所述二值化的图像的中心相应于所述已识别的实质上圆形的物体的中心；‑验证所述二值化的图像中的所述物体的圆形度；‑实施测试以识别所述物体的隔离区域以确定所述菌落的大小和所述菌落与其他菌落隔离的区域。