针对GTP酶KRas蛋白质 (KRas) 的SRM/MRM测定

摘要

本发明提供了来自GTP酶KRas蛋白质(KRas)的具体的肽和这些肽的衍生电离特性，其特别有利于通过选择反应监测(SRM)质谱或也可称作多反应监测(MRM)质谱的方法直接定量已经在福尔马林中固定的生物样品中的KRas蛋白质。这类生物样品是经化学保藏和固定的，该生物样品选自使用含有试剂/固定剂的甲醛处理的组织和细胞，包括福尔马林固定的组织/细胞、福尔马林固定/石蜡包埋(FFPE)的组织/细胞、FFPE组织块和来自那些块的细胞，以及经福尔马林固定和或石蜡包埋的组织培养细胞。使用Liquid Tissue试剂和方案从该生物样品中制备蛋白质样品并通过在蛋白质样品中定量至少一种或多种所描述的肽来使用SRM/MRM质谱的方法在Liquid Tissue样品中定量KRas蛋白质。这些肽在其以修饰的或未修饰的形式存在时可被定量。KRas肽的修饰的形式的一个示例是肽序列内酪氨酸、苏氨酸、丝氨酸和/或其他氨基酸残基的磷酸化。

主权项

一种测量生物样品中GTP酶KRas蛋白质(KRas)水平的方法，包括使用质谱检测和/或定量来自所述生物样品的蛋白质消化物中一种或多种修饰的或未修饰的KRas片段肽的含量；和计算所述样品中修饰的或未修饰的KRas蛋白质的水平；且其中所述水平是相对水平或绝对水平。