用于富集含稀有等位基因的物质的核酸分子的竞争性组合物

摘要

本发明公开了设计具有所需最优特异性的探针组合物所需要的热动力学设计和浓度，这种特异性使得能够在化学计量大幅过量的含主要等位基因的物质(野生型)中对含核酸的稀有等位基因的物质(流行性(prevalence)＜1％)进行富集、检测、定量、纯化、成像和扩增。作为无酶和均匀核酸富集组合物，这种技术与几乎所有基于核酸的生物技术广泛相容，包括对核酸的读板仪和荧光计读数、微阵列、PCR和其他酶促扩增反应、荧光条码化、基于纳米颗粒的纯化和定量、以及原位杂交成像技术。

主权项

一种核酸检测组合物，其包含：包含第一靶标探针寡核苷酸和第二靶标探针寡核苷酸的靶核酸探针，其中第一靶标探针寡核苷酸包含与靶核酸序列互补的靶标探针互补区，其中第二靶标探针寡核苷酸包含与靶标探针互补区的第一靶标探针互补子序列互补的靶标探针保护区从而提供靶标双链探针部分和靶标单链探针部分，其中所述靶标双链探针部分包含所述第一靶标探针互补子序列和所述靶标探针保护区，并且所述靶标单链探针部分包含所述靶标探针互补区的第二靶标探针互补子序列；靶标辅助寡核苷酸，其中所述靶标辅助寡核苷酸是与所述靶核酸探针分离的第二靶标探针寡核苷酸；包含第一变体探针寡核苷酸和第二变体探针寡核苷酸的变体核酸探针，其中第一变体探针寡核苷酸包含与变体核酸序列互补的变体探针互补区，其中第二变体探针寡核苷酸包含与变体探针互补区的第一变体探针互补子序列互补的变体探针保护区从而提供变体双链探针部分和变体单链探针部分，其中所述变体双链探针部分包含所述第一变体探针互补子序列和所述变体探针保护区，并且所述变体单链探针部分包含所述变体探针互补区的第二变体探针互补子序列，其中所述靶标探针互补区和所述变体探针互补区共有至少2个由非保守序列分隔的保守序列；和变体辅助寡核苷酸，其中所述变体辅助寡核苷酸是与所述变体核酸探针分离的第二变体寡核苷酸。