发明名称 |
肿瘤对应的基因的突变位点的获取方法及装置 |
摘要 |
本申请提供了一种肿瘤对应的基因的突变位点的获取方法及装置,涉及生物信息技术领域。该方法包括:将待测基因的多个短序列与参考基因组进行数据比对,获得待测基因的初步变异位点信息;根据初步变异位点信息,将多个初步变异位点中不满足预设保留条件的变异位点删除,将删除后获得的所述待测基因中的变异位点作为待检位点;将所述待检位点与肿瘤基因库中的肿瘤对应的基因的多个变异位点进行比较;当待检位点中存在与所述肿瘤基因库中位置相同且突变碱基相同的变异位点,获得待测基因中肿瘤对应的基因的位点突变情况。该方法及装置可以获得该待测基因中的变异位点中与肿瘤相关的多个变异位点的突变情况。 |
申请公布号 |
CN106407747A |
申请公布日期 |
2017.02.15 |
申请号 |
CN201610973342.0 |
申请日期 |
2016.11.04 |
申请人 |
成都鑫云解码科技有限公司 |
发明人 |
范振鑫;何苗;郭涛;刘鱼 |
分类号 |
G06F19/18(2011.01)I |
主分类号 |
G06F19/18(2011.01)I |
代理机构 |
北京超凡志成知识产权代理事务所(普通合伙) 11371 |
代理人 |
张海洋 |
主权项 |
一种肿瘤对应的基因的突变位点的获取方法,其特征在于,所述方法包括:将待测基因的多个短序列与参考基因组进行数据比对,获得待测基因的初步变异位点信息,所述初步变异位点信息中包括多个初步变异位点的突变碱基以及每个初步变异位点的位置信息;根据所述初步变异位点信息,将多个初步变异位点中不满足预设保留条件的变异位点删除,将删除后获得的所述待测基因中的变异位点作为待检位点;将所述待检位点与肿瘤基因库中的肿瘤对应的基因的多个变异位点进行比较,所述肿瘤基因库中包括肿瘤对应的基因的每个变异位点的突变碱基以及每个变异位点所在位置;当所述待检位点中存在与所述肿瘤基因库中位置相同且突变碱基相同的变异位点,获得所述待测基因中肿瘤对应的基因的位点突变情况。 |
地址 |
610094 四川省成都市高新区世纪城南路天府软件园D区6栋505号 |