一种InDel位点基因型分型的方法

摘要

本发明提供了一种InDel位点基因型分型的方法，包括以下步骤：1)将目的基因DNA序列进行T载体克隆测序，得到目的基因克隆产物序列，将所述目的基因克隆产物序列进行多重比对，得到InDel位点；2)根据所述InDel位点设计PCR扩增引物，所述PCR扩增引物包括正向引物和反向引物，所述正向引物的5'末端采用荧光基团修饰；3)用所述PCR扩增引物对待测样本DNA进行PCR扩增获得扩增产物，用毛细管荧光凝胶电泳检测扩增产物确定所述待测样本中InDel位点的基因型。本发明提供的基因型分型方法，成本低、操作简单灵活、结果准确。

主权项

一种InDel位点基因型分型的方法，包括以下步骤：1)将目的基因DNA序列进行T载体克隆测序，得到目的基因克隆产物序列，将所述目的基因克隆产物序列进行多重比对，得到InDel位点；2)根据所述InDel位点设计PCR扩增引物，所述PCR扩增引物包括正向引物和反向引物，所述正向引物的5'末端采用荧光基团修饰；3)用所述PCR扩增引物对待测样本全基因组DNA进行PCR扩增获得扩增产物，用毛细管荧光凝胶电泳检测扩增产物，若扩增产物中有两条条带则该InDel位点的基因型为杂合型ID；若有一条条带且片段大小与杂合型ID中大的片段相同，则该InDel位点基因型为插入纯合型II；若有一条条带且片段大小与杂合型ID中小的片段相同，则表示该InDel位点为缺失纯合型DD。