以P2Y12为靶点的计算药物设计方法及其应用

摘要

本发明以P2Y12为靶点的计算药物设计方法及其应用属于靶计算机辅助药物设计、小分子药物虚拟筛选、分子对接及全原子分子动力学技术领域，具体以P2Y12为靶点，以Chembridge小分子数据库为搜索数据库的药物虚拟筛选设计方法。本发明还包括靶点蛋白的空间结构分析、结合口袋定义方法以及构效关系分析方法。本发明已在相关蛋白靶点的药物设计方法中进行了多次验证，成功率极高。本发明方法已用于虚拟筛选GPCRs受体家族的抑制剂。

主权项

一种以P2Y12为靶点的计算药物设计方法，其特征在于以分子对接、虚拟筛选及分子动力学技术为基础进行计算机药物设计，其特征包含以下五个步骤：P2Y12晶体结构的获取及能量最小化优化；P2Y12受体与小分子结合口袋的定义；基于P2Y12结构分子对接及小分子数据库的高通量筛选；苗头化合物与受体结构分子对接及分子动力学模拟；先导化合物的生物活性测试。