检测生物分子的变化的方法和检测生物调控分子的变化的方法

摘要

本发明公开了一种检测生物分子的变化的方法，该方法包括：（1）用生物芯片或者高通量测序分别测量处理样品和对照样品，分别获得处理数据和对照数据；（2）使用对照数据对处理数据进行正规化，以获得无偏的基因表达差异数值；其中，在正规化中，在处理数据和对应的对照数据之间建立线性样条模型，用稳健统计估计法估计线性样条模型的参数，使用具有参数的线性样条模型校正处理数据中的数值，并作为正规化后的数值。本发明还提供了一种通过集成基因表达差异数值和生物调控分子与相应基因的结合强度来检测生物调控分子变化的量化指标的方法。本发明能够有效地挖掘高通量表达数据中的有用信息，并确定基因表达差异的调控机制。

主权项

一种检测生物分子的变化的方法，该方法包括：(1)用生物芯片或者高通量测序分别测量处理样品和对照样品，分别获得处理数据和对照数据；(2)使用对照数据对处理数据进行正规化，以获得无偏的基因表达差异数值；其中，在正规化中，在处理数据和对应的对照数据之间建立线性样条模型，用稳健统计估计法估计线性样条模型的参数；使用具有参数的线性样条模型校正处理数据中的数值，将校正后的数值作为正规化后的数值；其中，线性样条模型如式(1)所示：式(1)中，a、b₀、b_i(i＝1,…,n)分别为参数，n为任意正整数，A、B分别为对照数据构成的列向量和处理数据构成的列向量，I(B>c_i)为示性函数列向量，该示性函数列向量的元素值当B中相应元素大于c_i时为1，当B中相应元素小于等于c_i时为0，每个c_i为全体处理数据测量值的一个分位数，而且c_i随i的增大而增大；利用式(2)估计正规化之后的处理数据：式(2)中，分别为在式(1)中经过S估计或LTS估计得到的参数值。