直肠癌放化疗疗效相关靶基因的鉴定

摘要

本发明公开了一种直肠癌放化疗疗效相关靶基因的鉴定方法，其步骤包括：在PubMed数据库中检索直肠癌放化疗相关的microRNA，找到相关microRNA的靶基因，结合直肠癌病人的基因芯片数据以及统计分析，筛选得到与直肠癌放化疗特异相关的基因。本发明通过搜集已报道的与直肠癌密切相关的microRNA，结合microRNA‑mRNA调控关系以及基因芯片表达谱数据，并结合临床实验验证得到与直肠癌放化疗特异相关的靶基因。该筛选得到的基因可作为预测直肠癌放化疗疗效的标志物。

主权项

一种直肠癌放化疗疗效相关靶基因的鉴定方法，其步骤包括：A、在PubMed数据库中检索直肠癌放化疗相关的microRNA；B、基于检索到的microRNA，依据microRNA‑mRNA调控关系识别直肠癌放化疗反应相关microRNA的靶基因；C、从Gene Expression Omnibus的GSE35452数据集寻找差异表达的基因，采用R平台下limma软件包中的Student’s t检验方法，选取p‑value<0.05的基因；D、将步骤B获取的基因与步骤C获取的基因取交集，获得目标基因；E、利用DAVID工具对步骤D得到的目标基因进行基因本体论和KEGG信号通路富集分析，采用ANOVA检验基因本体论和KEGG信号通路的数据间差异；F、在直肠癌患者的病理样本中进行靶标基因的表达分析和放化疗疗效预测，判断目标基因的可靠性。