高维少样本的基因、信号通路和相关蛋白质的选取方法

摘要

本发明提供了一种高维少样本的基因、信号通路和相关蛋白质的选取方法，该方法包括：获取原始的GBM生存相关的基因表达数据，并对所述基因表达数据进行数据过滤，获得GBM预处理数据；基于所述GBM预处理数据建立比例风险模型，进行存活分析，并基于所述GBM预处理数据及存货分析结果，筛选选取关键基因；基于所述关键基因，进行路径分析，并获取GBM信号通路。该方法将Cos、S I S、Lasso方法结合在一起，有效处理高维低样本的GBM基因表达数据，筛选GBM关键基因的准确度大大提高。

主权项

高维少样本的基因、信号通路和相关蛋白质的选取方法，所述方法包括：步骤1、获取原始的GBM生存相关的基因表达数据，并对所述基因表达数据进行数据过滤，获得GBM预处理数据；步骤2、基于所述GBM预处理数据建立比例风险模型，进行存活分析，并基于所述GBM预处理数据及存货分析结果，筛选选取关键基因；所述比例风险模型采用Cox回归模型为公式1，具体为:h(t,x)＝h₀(t)exp(β₁x₁+β₁x₁+···+β_ix_i)  (1)，其中h(t,x)是病人在时间t的风险函数，h₀(t)是一个共有的危险基准函数；x₁,x₂...x_i是协变量；β₁,β₂...β_i是回归系数，由样本估计而得；步骤3、基于所述关键基因，进行路径分析，并获取GBM信号通路。