一种适合Ion Torrent测序平台的16S rRNA测序方法

摘要

本发明属于生物技术领域，更具体地说，涉及一种针对Ion Torrent高通量测序平台的Ion Torrent 16S rRNA测序引物设计、建库及高通量测序的方法，其包括样本DNA提取、16S rRNA测序引物设计、16S rRNA PCR 扩增、PCR 扩增产物纯化及定量、测序文库构建、高通量测序和序列分析，本发明的有益效果是：本发明的方法具有如下优点：(1)样品标记简单，(2)建库方法简单，(3)极大地降低测序成本，(4)位点选择灵活，(5)数据分析容易，非常适合中等数量样本的检测。

主权项

一种适合Ion Torrent 测序平台的16S rRNA测序方法，其包括样本DNA提取、16S rRNA测序引物设计、16S rRNA PCR 扩增、PCR 扩增产物纯化及定量、测序文库构建、高通量测序和序列分析，其特征在于：所述16S rRNA测序引物设计按如下步骤进行：（1）选取16S rRNA通用引物；（2）选取Ion Torrent 测序平台DNA 1‑96 barcode 序列；（3）在PCR 上游引物5’端加上barcode 序列，得到Ion Torrent 16S rRNA测序上游引物，在PCR 下游引物5’端加上同样的barcode 序列，得到Ion Torrent 16S rRNA测序下游引物。