精细调节的超特异性核酸杂交探针

摘要

本发明提供用于高特异性的核酸探针和引物的组合物和方法。探针系统包括互补链和保护链，以部分形成双链探针。式1所决定的探针和靶标核酸之间的杂交的反应标准自由能(ΔG^o_rxn＝ΔG^o_t‑TC‑ΔG^o_nh‑PC+(ΔG^o_v‑TC‑ΔG^o_h‑PC))为约‑4kcal/mol到+4kcal/mol。或者，式1所决定的探针和靶标核酸之间的杂交的反应标准自由能在式2所决定的标准自由能(‑Rτln(([P]₀‑[C]₀)/[C]₀)])的5kcal/mol以内，式2的术语[P]₀等于保护链的浓度且式2的术语[C]₀等于互补链的浓度。另外，本发明提供使用本发明的探针的用于即时精细调节反应的方法。

主权项

一种用于与靶标核酸分子选择性相互作用的组合物，其特征在于，该组合物包括：第一浓度的包含第一区域、第二区域和第三区域的第一核酸链；第二浓度的包含第四区域和第五区域的第二核酸链，其中靶标核酸分子包括第六区域和第七区域；其中，第一和第二浓度使得靶标核酸和组合物之间的相互作用具有式2所决定的标准自由能的5kcal/mol以内的式1所决定的标准自由能，其中式2的术语[P]₀等于第二浓度，式2的术语[C]₀等于第一浓度；且其中，式1的术语ΔG°_t‑TC表示第六区域和第一区域之间的杂交的标准自由能；术语ΔG°_nh‑PC表示第五区域和第三区域之间的杂交的自由能；式1的术语ΔG°_v‑TC表示第七区域和第二区域之间的杂交的标准自由能；式1的术语ΔG°_h‑PC表示第四区域和第二区域之间的杂交的标准自由能。