一种检测海洋环境中β‑变形菌群落的基因芯片

摘要

本发明提供一种检测海洋环境γ‑变形菌群落的基因芯片，包括有芯片载体，以及固定在芯片载体上的，用于检测海水中的Alcaligenaceae菌、Burkholderiaceae菌、Comamonadaceae菌、Hydrogenophilaceae菌、Methylophilaceae菌、Neisseriaceae菌、Nitrosomonadaceae菌、Oxalobacteraceae菌、Rhodocyclaceae菌的探针。本发明芯片所使用的探针可以快速、高通量地对海水中的β‑变形菌群落进行检测，最大可以检测9个科的β‑变形菌信息，从而为海洋环境细菌群落的监测提供了有力的技术支持，为建立、健全近岸海域海洋环境质量综合评价体系奠定了坚实的基础。

主权项

一种基因芯片，其特征在于，所述的基因芯片包含有芯片载体，以及固定在芯片载体上的，用于检测海水中的Alcaligenaceae菌、Burkholderiaceae菌、Comamonadaceae菌、Hydrogenophilaceae菌、Methylophilaceae菌、Neisseriaceae菌、Nitrosomonadaceae菌、Oxalobacteraceae菌、Rhodocyclaceae菌中的任一种的探针，其中用于检测Alcaligenaceae菌的核酸探针，其核苷酸序列为SEQ ID NO:1‑3中的任一种或几种；用于检测Alcanivoracaceae菌的核酸探针，其核苷酸序列为SEQ ID NO:4‑6中的任一种或几种；用于检测Comamonadaceae菌的核酸探针，其核苷酸序列为SEQ ID NO:7‑9中的任一种或几种；用于检测Hydrogenophilaceae菌的核酸探针，其核苷酸序列为SEQ IDNO:10‑12中的任一种或几种；用于检测Methylophilaceae菌的核酸探针，其核苷酸序列为SEQ IDNO:13‑15中的任一种或几种；用于检测Neisseriaceae菌的核酸探针，其核苷酸序列为SEQ ID NO:16‑18中的任一种或几种；用于检测Nitrosomonadaceae菌的核酸探针，其核苷酸序列为SEQ IDNO:19‑21中的任一种或几种；用于检测Oxalobacteraceae菌的核酸探针，其核苷酸序列为SEQ IDNO:22‑23中的任一种或几种；用于检测Rhodocyclaceae菌的核酸探针，其核苷酸序列为SEQ ID NO:24‑26中的任一种或几种。