基于微流体芯片技术的5种根结线虫等温扩增检测引物序列及其应用

摘要

本发明公开了基于微流体芯片技术的5种根结线虫等温扩增检测引物序列及其应用，特点是根据苹果根结线虫的rDNA‑ITS、北方根结线虫的rDNA‑ITS、花生根结线虫的IGS2序列、爪哇根结线虫的SCAR序列、以及南方根结线虫的RAPD序列各设计三对引物序列，建立等温扩增微流体芯片检测体系，完成苹果根结线虫、北方根结线虫、花生根结线虫、爪哇根结线虫，以及南方根结线虫的检测，其中各引物序列如SEQ ID NO.1‑30所示，优点是检测物种数和样本数多、操作简单快捷，高灵敏度和特异性。

主权项

一种基于微流体芯片技术的5种根结线虫等温扩增检测引物序列，其特征在于根据苹果根结线虫的核糖体DNA的内转录间隔区序列（rDNA‑ITS）、北方根结线虫的核糖体DNA的内转录间隔区序列（rDNA‑ITS）、花生根结线虫的基因间隔区序列（IGS2）、爪哇根结线虫的SCAR序列、以及南方根结线虫的RAPD序列各设计三对引物序列，其中用于检测苹果根结线虫的引物序列是：Mma‑F3：TGCTGCTGGATCATTACAC，Mma‑B3: TCCTGGGCTCATTAAGTCT，Mma‑FIP: CGACGTATCCTCCCAATCTTGTCGCAATGAGCCTTGTTATTG，Mma‑BIP: CGACTCTCGTCGTGTAACGGGATGGCACAACTGCTCAG，Mma‑LF：CGTGGAGTAGACGAAGAAATCT，Mma‑LB：CTACGCTGGTGTCTGTGT；用于检测北方根结线虫的引物序列是：Mha‑F3：GGGTTTAAGACTTAATGAGCCT，Mha‑B3：CGCTGCGTACCAACATTA，Mha‑FIP：GCAGTTCGCACAAATTATCGCATTTTATCCTTGTCGGTGGATC，Mha‑BIP：TTTGAATGCAAATTGCGGCACTAAAATGACCCTGAACCAGAC，Mha‑LF：AGCTGCGTTCTTCATGGAT，Mha‑LB：GGGTAGAACCCTTTGCCA；用于检测花生根结线虫、爪哇根结线虫和南方根结线虫的通用引物序列是：Mar‑F3： GCGGTATGGTCGTAATCAAT，Mar‑B3：AATGACAGCTGATAACATACT，Mar‑FIP：TTTCTCTCCACGAGTTTCTAGATTCGATGTTCGCTGTTCG，Mar‑BIP：TCCTTTATTGACTCTCGCTGCAATCGGCTAAATTCCTGACAA，Mar‑LF：AGCCCAATTTGAGTTTTCCTTT，Mar‑LB：AAATTAATTTGGCTTCTGGCAA；用于检测爪哇根结线虫的引物序列是：Mja‑F3: ACACTGTTACGTATCAACTTGT，Mja‑B3：TAAACCCAGCTAGGAACCA，Mja‑FIP：CGATTTCCGACTTTTGAGCCATAATGACGAAGGTGTCGGA，Mja‑BIP：TCGGAAATCGGAATTCCAGCCATTTTCCCCATTTATTCGCAAG，Mja‑LF：CGATTTCCGACAGTTCCCA，Mja‑LB：GGGGTAATAATGGGGTGTTGT；用于检测南方根结线虫的引物序列是：Min‑F3：TTTCCTCAATAGGACGGTATAC，Min‑B3：ACGAACCGCGATATTTCAA，Min‑FIP：AAAATCTGTTTCGGCACACCCTATCCAAGACCCAATGGC，Min‑BIP：AAAAGCAAAAGACGAAGCACCAATACCAGGGATGTGCCTT，Min‑LF：CCCTGGTTTCAGGACCTATG，Min‑LB：GACGAAAATTCGGCAAAAAGC。