用于检测碎片化DNA目标区域的引物组合物及其应用

摘要

本发明公开了用于检测碎片化DNA目标区域的引物组合物及其应用，其中该引物组合物包括：第一引物组，所述第一引物组包含第一通用引物和第二通用引物，所述第一通用引物和所述第二通用引物的靶点位于所述目标区域的两端，分别用于构成测序文库的5’端和3’端；以及第二引物组，所述第二引物组包括第一特异性引物组和第二特异性引物组。利用本发明的引物组合物对碎片化DNA的目标区域进行扩增富集，能够显著提高引物扩增的适应范围和有效模板量，进而对富集产物进行测序检测，能够显著提高碎片化DNA的检测灵敏度。

主权项

一种用于检测碎片化DNA目标区域的引物组合物，其特征在于，包括：第一引物组，所述第一引物组包含第一通用引物和第二通用引物，所述第一通用引物和所述第二通用引物的靶点位于所述目标区域的两端，分别用于构成测序文库的5’端和3’端；以及第二引物组，所述第二引物组包括第一特异性引物组和第二特异性引物组，其中，所述第一特异性引物组和所述第二特异性引物组均包含n条目标区域特异性引物，且所述第一特异性引物组和所述第二特异性引物组必须满足下列条件：(1)所述第一特异性引物组和所述第二特异性引物组的各特异性引物均同向延伸，靶点均位于所述碎片化DNA目标区域的5’端或3’端；(2)n＝1‑5的任意整数，以n＝5为例，设所述第一特异性引物组的各特异性引物分别为：N₁、N₂、N₃、N₄、N₅，所述第二特异性引物组的各特异性引物分别为：M₁、M₂、M₃、M₄、M₅，以特异性引物的靶点与目标区域之间的距离为衡量标准，所述第一特异性引物组和所述第二特异性引物组的各特异性引物之间的距离远近关系为：N₁>N₂>N₃>N₄>N₅；M₁>M₂>M₃>M₄>M₅；N₁>M₁；N₂>M₂；N₃>M₃；N₄>M₄；且N₅>M₅，其中，所述第一特异性引物组和所述第二特异性引物组的各特异性引物的靶点，与所述第一通用引物的靶点分别位于所述目标区域的两端，与所述第二通用引物的靶点位于所述目标区域的同端。