发明名称 |
用于组装基因组序列的方法、系统及装置 |
摘要 |
本申请提供一种利用锚点序列对待组装序列进行压缩并进行基因序列组装的方法,包括获取一待组装序列集的数据和多个锚点序列的数据;利用所述多个锚点序列,对所述待组装序列集中的每一个待组装序列进行压缩以获得该待组装序列的索引表,其中所述索引表以锚点序列的标号的序列来表示;以及利用所述待组装序列集中各待组装序列压缩得到的所述索引表进行比对并构建组装骨架。 |
申请公布号 |
CN105989249A |
申请公布日期 |
2016.10.05 |
申请号 |
CN201510084489.X |
申请日期 |
2015.02.16 |
申请人 |
叶承羲 |
发明人 |
叶承羲 |
分类号 |
G06F19/22(2011.01)I |
主分类号 |
G06F19/22(2011.01)I |
代理机构 |
北京商专永信知识产权代理事务所(普通合伙) 11400 |
代理人 |
邬玥;葛强 |
主权项 |
一种用于组装基因序列的方法,包括:获取一待组装序列集的数据和多个锚点序列的数据;利用所述多个锚点序列,对所述待组装序列集中的每一个待组装序列进行压缩以获得该待组装序列的索引表,其中所述索引表以锚点序列的标号来表示;以及利用所述待组装序列集中各待组装序列压缩得到的所述索引表构建组装骨架。 |
地址 |
518031 广东省深圳市福田区华发南路爱华大院21栋806 |