新疆野扁桃TP-M13-SSR核心引物及其应用

摘要

本发明涉及一种新疆野扁桃TP‑M13‑SSR核心引物及其应用，该引物具有扩增稳定、电泳条带清晰、多态性丰富的优点，利用在TP‑M13‑SSR扩增产物检测过程中的一种基于荧光测序技术的高通量低成本分析技术体系，本发明公开了新疆野扁桃TP‑M13‑SSR引物，它包括12对引物，本发明筛选出的12对TP‑M13‑SSR核心引物在新疆野扁桃基因组中分布均匀，带型清晰容易判读，同时适合普通变性聚丙烯酰胺凝胶电泳检测平台和毛细管荧光检测平台检测；多态性高；扩增重复性好，可完全适用于新疆野扁桃遗传多样性分析、品种鉴定以及聚类分析等方面的研究。

主权项

一种新疆野扁桃TP‑M13‑SSR核心引物，其特征在于该核心引物为12对引物序列：引物名称：PT‑1TP‑M13引物序列(5'‑3')：TGTAAAACGACGGCCAGTGCACCGAATTCTCTCAGACCSSR正向引物序列(5'‑3')：TTAATTAAACGCCGCCAAGA引物名称：PT‑2TP‑M13引物序列(5'‑3')：TGTAAAACGACGGCCAGTCCCACCTATTATTTCAGCCAASSR正向引物序列(5'‑3')：TTGGAATGGAGCTTGGAAGT引物名称：PT‑3TP‑M13引物序列(5'‑3')：TGTAAAACGACGGCCAGTTTGGACTTGCCTCAACAGACSSR正向引物序列(5'‑3')：TCTTCTTTGTCTCTCGCTTGTG引物名称：PT‑4TP‑M13引物序列(5'‑3')：TGTAAAACGACGGCCAGTGCGTGCATCTCTCTGGGTTSSR正向引物序列(5'‑3')：CATAACTGTAATCATCTTAAGTCTGGG引物名称：PT‑5TP‑M13引物序列(5'‑3')：TGTAAAACGACGGCCAGTAATTCTCTCTGGGCTTTGGCSSR正向引物序列(5'‑3')：GGACTGTAACCAGACACCTCATT引物名称：PT‑6TP‑M13引物序列(5'‑3')：TGTAAAACGACGGCCAGTTGCATGATTGGCATGTATGTTSSR正向引物序列(5'‑3')：CATCAATCTGTGTATGCGGG引物名称：PT‑7TP‑M13引物序列(5'‑3')：TGTAAAACGACGGCCAGTGGAAGTATTGCTTTGGTTTCCTSSR正向引物序列(5'‑3')：AAATGTGTCCTTATAGTCCCTTCG引物名称：PT‑8TP‑M13引物序列(5'‑3')：TGTAAAACGACGGCCAGTAGACATCATTAGTTGCACCCACSSR正向引物序列(5'‑3')：GCTTCTCAAAGGAAGTGGCA引物名称：PT‑9TP‑M13引物序列(5'‑3')：TGTAAAACGACGGCCAGTTTGGCAGCAGACTTGTTGACSSR正向引物序列(5'‑3')：AGGACCATGGATAGTGCTCG引物名称：PT‑10TP‑M13引物序列(5'‑3')：TGTAAAACGACGGCCAGTATCTGCCGAAGACTTGCATCSSR正向引物序列(5'‑3')：AAAGAAGATGACCTGCCACG引物名称：PT‑11TP‑M13引物序列(5'‑3')：TGTAAAACGACGGCCAGTCTTGCATGCTTAAATTAGGGCSSR正向引物序列(5'‑3')：AAGCCTGAGCATCAGAAACAA引物名称：PT‑12TP‑M13引物序列(5'‑3')：TGTAAAACGACGGCCAGTTTGATGTTTGAATAGGTCGAAGASSR正向引物序列(5'‑3')：CCACATGAACAAGGTGCAAG注：下划线部分序列为5'端M13接头。