用于检测目标核酸的方法与组合物

摘要

本发明提供用于检测存在于样品中的一个或多个核酸目标的组合物、设备和方法。本发明的方法包括利用两个或更多个接合探针，这些接合探针以可逆方式彼此紧密结合目标核酸并且具有互补的反应性接合部分。当这些探针已经按适当定向结合到目标上时，其能够经历自发化学接合反应，得到接合产物，对这种接合产物直接进行检测，或扩增这种接合产物以产生扩增子，然后对这些扩增子进行检测。本发明还提供用以稳定样品RNA以使得降解不会显著影响分析结果的方法。

主权项

一种扩增样品中多个不同目标核酸的方法，其中包含：(a)提供多个接合衬底，各自包含：(i)多个目标核酸中的一种，其中每个目标核酸包含与第二目标结构域相邻的第一目标结构域和位于所述第一目标结构域和第二目标结构域上游或下游的第三目标捕获结构域；(ii)第一组接合探针，包含：(A)第一核酸接合探针，包含：(1)与所述多个目标核酸中的一种的第一目标结构域杂交的第一探针结构域；(2)5'‑接合部分；以及(B)第二核酸接合探针，包含：(1)与所述多个目标核酸中的一种的第二目标结构域杂交的第二探针结构域；以及(2)3'接合部分；(b)在不使用接合酶的情况下接合所述第一核酸接合探针和第二核酸接合探针以形成第一多个接合产物；(c)使包含捕获部分的目标捕获探针与所述目标核酸的所述第三目标结构域杂交以形成目标复合物；(d)使用所述捕获部分在表面上捕获所述目标复合物；和(e)扩增所述接合产物以形成扩增子。