一种沙门氏菌血清型鉴定方法及其试剂盒

摘要

本发明提供一种沙门氏菌血清型鉴定方法，包括：1)提取待测样品中的DNA；2)将步骤1)获得的DNA作为模板，进行PCR检测，其中，PCR检测靶标为沙门氏菌CRISPR1和CRISPR2；3)将步骤2)中的PCR产物进行序列测定；4)借助在线免费软件CRISPRfinder，寻找对应CRISPR的前三个间隔序列，并与各血清型标准间隔序列进行同源比对；5)比对结果的判断，可同时鉴定23种沙门氏菌常见血清型。本发明还提供了一种沙门氏菌血清型的鉴定试剂盒，所述试剂盒包括用于扩增沙门氏菌CRISPR1和CRISPR2的引物，并提供23种沙门氏菌常见血清型的标准间隔序列表。

主权项

一种非疾病诊断和治疗目的的沙门氏菌血清型鉴定方法，其特征在于，包括步骤：1)提取待检测样品中的DNA；2)将步骤1)获得的DNA作为模板，进行PCR检测；其中，PCR检测的靶标为沙门氏菌CRISPR1和CRISPR2，其中检测CRISPR1所用的引物为：CRISPR1‑F：5'‑ATAATGCTGCCGTTGGTAA‑3'和CRISPR1‑R：5'‑TTGAT GAGTATGGTGGTTGTGGT‑3'，检测CRISPR2所用的引物为：CRISPR2‑F：5'‑CTGTATAAAAGCCTCCCC‑3'和CRISPR2‑R：5'‑GTTGGTAGAATGTGGTGC‑3'；3)将步骤2)中的PCR产物进行序列测定；4)借助在线免费软件CRISPRfinder，寻找对应CRISPR位点的前三个间隔序列，并与各血清型标准间隔序列进行同源比对；5)比对结果的判断：样品的CRISPR1和CRISPR2的间隔序列分别与某一标准血清型的CRISPR1和CRISPR2间隔序列至少有两个一致则判定为对应的血清型；其中，蒙得维亚沙门氏菌和伤寒沙门氏菌只需比对CRISPR1基因的前三个间隔序列即可。