神经胶质瘤分子分型基因群及其应用

摘要

本发明公开了神经胶质瘤分子分型基因群及其应用。本发明提供了一组用于预测或辅助预测神经胶质瘤患者预后生存期的基因群，由PM基因群和EM基因群组成，该用于预测或辅助预测神经胶质瘤患者预后生存期的基因群有68个基因，这些基因与神经干细胞、祖细胞的增殖和分化以及肿瘤的产生和恶化密切相关。本发明的实验证明，本发明所获得的与PDGFRA和EGFR共表达的两大基因群共68个基因所组成的分型标志基因群可将不同数据库来源的神经胶质瘤样本稳定地区分为三个特异亚型，极大地克服了现有形态学诊断的局限性，可应用于神经胶质瘤临床诊断而指导临床治疗，并可判断神经胶质瘤患者的预后生存期。

主权项

一种预测或辅助预测神经胶质瘤患者预后生存期的试剂盒，包括用于检测待测神经胶质瘤患者离体样本中PM基因群和EM基因群中的各个基因的表达量的试剂和比对卡；所述PM基因群由如下39个基因组成：C10orf18、C1QL1、C1orf106、C9orf140、CACNG4、CHD7、CSNK1E、EIF4EBP2、ETV1、FAM5C、KLRC3、LIX1L、LOC283174、LPHN3、LPPR1、MARCKS、MEX3A、MMP16、MYT1、NAV1、NLGN1、NOVA1、NXPH1、OLIG1、OLIG2、PATZ1、PCGF2、PDGFRA、POLR2F、RFX7、SOX4、SOX6、SOX8、TACC2、TMCC1、TSHZ1、ZEB1、ZNF22、ZNF462；所述EM基因群由如下29个基因组成：ACSS3、CDKN2C、DENND2A、DMRTA2、EGFR、ELOVL2、HS3ST3B1、ITGB8、LFNG、NCOA3、NES、NFIA、PDGFA、PMS2P11、POU3F2、PRPF31、RNF180、SALL1、SEC61G、SEMA6D、SHOX2、SNX5、SOCS2、SOX9、TNFRSF19、TRIOBP、UHRF1、VAV3、ZNF558；所述比对卡记载如下内容：若所述待测神经胶质瘤患者离体样本中所述PM基因群平均表达量大于或等于所述EM基因群平均表达量，则所述待测神经胶质瘤患者的预后生存期超过或候选超过1.9年；若所述待测神经胶质瘤患者离体样本中所述PM基因群平均表达量小于所述EM基因群平均表达量，则所述待测神经胶质瘤患者的预后生存期不超过或候选不超过1.9年。