一种中药制剂非处方物种化学成分的网络药理分析方法

摘要

本发明是一种基于系统生物学的中药制剂非处方物种化学成分的网络药理分析方法。本发明包括以下步骤：获得待分析中药制剂的生物物种成分，包括处方物种和非处方物种；获得上述非处方物种的化学成分，对所述化学成分的不同格式文件进行标准化处理；利用STITCH数据库建立上述非处方物种化学成分与人蛋白的联系，得到待分析中药制剂非处方物种化学成分与蛋白相互作用关系文件；建立所获得人蛋白之间的相互作用关系，得到人蛋白之间相互作用关系文件；构建“中药制剂非处方物种化学成分---人蛋白---疾病”网络。本发明以中药制剂中非处方物种的化学成分作为研究对象，基于系统生物学思路，利用网络分析技术对其进行研究。

主权项

一种中药制剂非处方物种化学成分的网络药理分析方法，其特征在于，包括以下步骤：步骤1：根据中华人民共和国药典和对中药制剂中生物成分分析的实验结果获得待分析中药制剂的生物物种成分，包括处方物种和非处方物种；步骤2：获得上述非处方物种的化学成分，对所述化学成分的不同格式文件进行标准化处理；步骤3：将STITCH数据库中化学成分进行同样的标准化处理，利用STITCH数据库建立上述非处方物种化学成分与人蛋白的联系，得到待分析中药制剂非处方物种化学成分与蛋白相互作用关系文件；然后在STRING数据库中建立所获得人蛋白之间的相互作用关系，得到人蛋白之间相互作用关系文件；步骤4：根据OMIM数据库得到OMIM号与基因关系对应文件，利用Clone/Gene IDconverter工具将基因名称转换为“ENSG”形式的ID信息，同时将STRING数据库中已得的蛋白质信息进行相同性质的处理，使转换后的ID统一化后经过筛选匹配就可以得到OMIM号与人蛋白相互关系文件，然后利用步骤3中已经得到的待分析中药制剂非处方物种化学成分与蛋白相互作用文件和人蛋白之间相互作用关系文件，共三个文件在Cytoscape软件中构建“中药制剂非处方物种化学成分‑‑‑人蛋白‑‑‑疾病”网络。