一种1号染色体替换实验小鼠品系C57BL/6-Chr1^AKR的构建方法

摘要

本发明涉及一种1号染色体替换实验小鼠品系C57BL/6‑Chr1^AKR的构建。本发明构建了一种新的染色体替代实验小鼠品系，该小鼠品系的遗传背景以C57BL/6小鼠为主，但其中1号染色体来自于AKR小鼠。本发明的染色体替换品系可用于研究在相同基因组背景下，由不同的1号染色体基因组带来的性状差异，是采用遗传学方法研究染色体基因组功能的有用工具。

主权项

一种1号染色体替换实验小鼠品系C57BL/6‑Chr1^AKR的建立方法，其特征在于，所述方法包括：(1)以AKR品系小鼠作为母本、C57BL/6品系小鼠作为父本进行杂交，获得F1代小鼠；(2)将F1代雄性小鼠与C57BL/6品系雌性小鼠杂交，获得回交一代小鼠；该回交小鼠中，AKR品系小鼠中的性染色体和线粒体DNA被替换为C57BL/6品系小鼠中的性染色体和线粒体DNA；使用多核苷酸多态性位点鉴定该雄性回交小鼠的1号染色体，选择1号染色体多核苷酸多态性位点鉴定结果为AKR品系小鼠所特有的雄性回交小鼠；使用短串联重复序列位点鉴定选择到的雄性回交小鼠，选择1号染色体短串联重复序列位点鉴定结果为AKR品系小鼠所特有的回交小鼠；(3)将选择到的1号染色体短串联重复序列位点鉴定结果为AKR品系小鼠所特有的回交小鼠中雄性回交小鼠与C57BL/6品系雌性小鼠杂交，获得下一代回交小鼠；(4)使用多核苷酸多态性位点鉴定步骤(3)获得的雄性回交小鼠的1号染色体，选择1号染色体多核苷酸多态性位点鉴定结果为AKR品系小鼠所特有的雄性回交小鼠；使用短串联重复序列位点鉴定选择到的雄性回交小鼠，选择1号染色体短串联重复序列位点鉴定结果为AKR品系小鼠所特有的回交小鼠；(5)重复步骤(3)～(4)5‑50次；从而获得染色体替代动物品系，其以C57BL/6品系小鼠为背景，且其1号染色体被AKR品系小鼠的1号染色体替换；其中，所述的1号染色体多核苷酸多态性位点包括：rs30719154，其在1号染色体上所处位置为chr1：3052360；在AKR品系小鼠染色体相应位置的碱基为G，在C57BL/6品系小鼠染色体相应位置的碱基为T；rs31426703，其在1号染色体上所处位置为chr1：12720994；在AKR品系小鼠染色体相应位置的碱基为C，在C57BL/6品系小鼠染色体相应位置的碱基为T；rs31928308，其在1号染色体上所处位置为chr1：28659508；在AKR品系小鼠染色体相应位置的碱基为A，在C57BL/6品系小鼠染色体相应位置的碱基为G；rs32539840，其在1号染色体上所处位置为chr1：35672358；在AKR品系小鼠染色体相应位置的碱基为G，在C57BL/6品系小鼠染色体相应位置的碱基为A；rs32139742，其在1号染色体上所处位置为chr1：40806614；在AKR品系小鼠染色体相应位置的碱基为G，在C57BL/6品系小鼠染色体相应位置的碱基为A；rs31336640，其在1号染色体上所处位置为chr1：47136503；在AKR品系小鼠染色体相应位置的碱基为G，在C57BL/6品系小鼠染色体相应位置的碱基为A；rs32495825，其在1号染色体上所处位置为chr1：124737843；在AKR品系小鼠染色体相应位置的碱基为G，在C57BL/6品系小鼠染色体相应位置的碱基为A；rs30902647，其在1号染色体上所处位置为chr1：150127783；在AKR品系小鼠染色体相应位置的碱基为T，在C57BL/6品系小鼠染色体相应位置的碱基为C；rs3678938，其在1号染色体上所处位置为chr1：158391632；在AKR品系小鼠染色体相应位置的碱基为G，在C57BL/6品系小鼠染色体相应位置的碱基为A；rs6382951，其在1号染色体上所处位置为chr1：175245481；在AKR品系小鼠染色体相应位置的碱基为G，在C57BL/6品系小鼠染色体相应位置的碱基为A；rs32366433，其在1号染色体上所处位置为chr1：188750111；在AKR品系小鼠染色体相应位置的碱基为C，在C57BL/6品系小鼠染色体相应位置的碱基为T；rs31145145，其在1号染色体上所处位置为chr1：192018789；在AKR品系小鼠染色体相应位置的碱基为C，在C57BL/6品系小鼠染色体相应位置的碱基为T；rs6181686，其在1号染色体上所处位置为chr1：195479631；在AKR品系小鼠染色体相应位置的碱基为G，在C57BL/6品系小鼠染色体相应位置的碱基为A；其中，所述的1号染色体的短串联重复序列位点包括：D1MIT303，其在1号染色体上所处位置为32cM；在AKR品系小鼠基因组和C57BL/6品系小鼠染色体中，相应位置上基因序列长度差异10bp，C57BL/6品系小鼠比AKR品系小鼠多5个2bp碱基重复；D1MIT387，其在1号染色体上所处位置为51.5cM；在AKR品系小鼠基因组和C57BL/6品系小鼠染色体中，相应位置上基因序列长度差异16bp，C57BL/6品系小鼠比AKR品系小鼠少8个2bp碱基重复；D1MIT113，其在1号染色体上所处位置为79.54cM；在AKR品系小鼠基因组和C57BL/6品系小鼠染色体中，相应位置上基因序列长度差异20bp，C57BL/6品系小鼠比AKR品系小鼠少10个2bp碱基重复；D1MIT209，其在1号染色体上所处位置为96cM；在AKR品系小鼠基因组和C57BL/6品系小鼠染色体中，相应位置上基因序列长度差异10bp，C57BL/6品系小鼠比AKR品系小鼠多5个碱基重复。