| 发明名称 | 确定探针集的方法、试剂盒及其用途 | ||
| 摘要 | 本发明公开一种确定探针集的方法，所述探针集包含多个探针，所述方法包括：获取DNA序列集，所述DNA序列集包含多条长度为K<sub>0</sub>的DNA序列，获取所述DNA序列集包括，从长度为L的参考序列的一端的第i个核苷酸开始，沿另一端方向拷贝所述参考序列的K<sub>0</sub>个连续核苷酸为一条DNA序列，i依次取{1，2，…，(L-K<sub>0</sub>)，(L-K<sub>0</sub>+1)}中的数值；筛选所述DNA序列集，以获得所述探针，其中包括，过滤掉与所述参考序列的匹配位置个数大于2的DNA序列；其中，200nt≥K<sub>0</sub>≥50nt。本发明还公开一种试剂盒、该试剂盒的用途以及一种确定物种丰度的方法。 | ||
| 申请公布号 | CN105787294A | 申请公布日期 | 2016.07.20 |
| 申请号 | CN201410817092.2 | 申请日期 | 2014.12.24 |
| 申请人 | 深圳华大基因研究院 | 发明人 | 周欣;刘山林;王欣;张浩;李振宇 |
| 分类号 | G06F19/20(2011.01)I;C12Q1/68(2006.01)I | 主分类号 | G06F19/20(2011.01)I |
| 代理机构 | 北京清亦华知识产权代理事务所(普通合伙) 11201 | 代理人 | 李志东 |
| 主权项 | 一种确定探针集的方法，所述探针集包含多个探针，其特征在于，所述方法包括，获取DNA序列集，所述DNA序列集包含多条长度为K<sub>0</sub>的DNA序列，获取所述DNA序列集包括，从长度为L的参考序列的一端的第i个核苷酸开始，沿另一端方向拷贝所述参考序列的K<sub>0</sub>个连续核苷酸为一条DNA序列，i依次取{1，2，…，(L‑K<sub>0</sub>)，(L‑K<sub>0</sub>+1)}中的数值；筛选所述DNA序列集，以获得所述探针，其中包括，过滤掉与所述参考序列的匹配位置个数大于1的DNA序列；其中，L＞K<sub>0</sub>，200nt≥K<sub>0</sub>≥50nt。 | ||
| 地址 | 518083 广东省深圳市盐田区北山工业区综合楼 | ||