DNA条形码制备方法及草莓疫霉红心病菌DNA条形码

摘要

本申请公开了一种DNA条形码制备方法及草莓疫霉红心病菌DNA条形码。本申请的制备方法，包括用高通量测序技术对靶标菌株基因组DNA进行测序，并对测序结果进行生物信息学分析，采用系统进化树分析基因组DNA中各基因片段进化关系，获得靶标菌株与同属菌株的相似度大于或等于95％、小于100％，片段不大于1000bp的单拷贝基因片段，对单拷贝基因片段进行遗传距离分析，能真实反映亲缘关系的即靶标菌株DNA条形码。本申请的制备方法，利用高通量测序技术对基因组DNA进行全面分析，并用系统进化树和遗传距离分析，获得DNA条形码；为DNA条形码制备提供了一种简单、有效途径；获得的DNA条形码能最有效表征靶标菌株。

主权项

一种DNA条形码的制备方法，其特征在于：包括采用高通量测序技术对靶标菌株的基因组DNA进行测序，并对测序结果进行生物信息学分析，然后采用系统进化树分析基因组DNA中各个基因片段的进化关系，获得靶标菌株与同属其它菌株的相似度大于或等于95％、而小于100％，并且片段不大于1000bp的单拷贝基因片段，对所述单拷贝基因片段进行遗传距离分析，其中能够真实反映亲缘关系的单拷贝基因片段即所述靶标菌株的DNA条形码。