发明名称 一种基于Ion Torrent测序平台的乳腺癌基因BRCA的DNA文库构建方法
摘要 本发明公开了一种基于Ion Torrent测序平台的乳腺癌基因BRCA的DNA文库构建方法,包括多重PCR富集目的片段、引物清除、接头连接、文库扩增、文库检测等步骤。本发明的构建方法采用多对PCR引物对目的片段进行富集扩增,操作简单,成本低,降低了文库的损失,提高了文库构建成功率。本发明的文库构建方法适用于在Ion TorrentTM测序平台上进行BRCA1和BRCA2基因的DNA文库测序使用。
申请公布号 CN105696089A 申请公布日期 2016.06.22
申请号 CN201610140822.9 申请日期 2016.03.11
申请人 浙江圣庭生物科技有限公司 发明人 杜宝珠;蔡乐靖;钱飞箭;卢灵潇;丁志远;陈帼婧;陈贤丰
分类号 C40B50/06(2006.01)I;C40B40/08(2006.01)I;C12Q1/68(2006.01)I 主分类号 C40B50/06(2006.01)I
代理机构 北京华仲龙腾专利代理事务所(普通合伙) 11548 代理人 李静
主权项 一种基于Ion Torren测序平台的乳腺癌基因BRCA的DNA文库构建方法,其特征在于,具体步骤如下:(1)目标区域扩增:将待测样本的DNA以及多重PCR引物,经多重PCR反应,得到第一样本;(2)引物清除:取第一样本与引物清除试剂混合进行反应,得到第二样本;(3)接头连接:将第二样本与接头P1进行接头连接反应,得到第三样本;(4)磁珠纯化:将第三样本进行磁珠纯化,得到第四样本;(5)文库扩增:将第四样本加入扩增酶Mix和扩增引物进行PCR扩增,并进行磁珠纯化,得到目的DNA文库;(6)文库检测:将得到的文库采用Qubit和11~13%的聚丙烯酰胺凝胶电泳检测文库浓度、文库片段大小及文库质量,即得;所述11~13%的PAGE配方为:水,3~4mL;30%丙烯酰胺,2022~2062μL;5*TBE,1.2~1.8mL;9~11%AP,100~120μL;TEMED,9~11μL。
地址 318020 浙江省台州市黄岩区东城街道东浦社区王西路41号