发明名称 |
同时确定多种样本的线粒体基因组序列信息的方法和系统 |
摘要 |
本发明公开了同时确定多种样本的线粒体基因组序列信息的方法和系统,其中该多种样本所属种相互不同,该方法包括以下步骤:提供所述多种样本中每一种的基因组DNA并混合;将DNA混合物进行文库构建;对DNA测序文库进行测序;将多个测序序列进行筛选,以便获得目标序列;将目标序列进行序列组装,以便获得多个组装序列;将多种样本中每一种进行形态学物种分类,以便获得多种样本的形态学物种分类信息;基于多种样本的形态学物种分类信息,参考线粒体蛋白基因数据库,将该组装序列进行物种分配,以便确定多种样本中每一种的组装序列;以及基于所述多种样本中每一种的组装序列,分别构建各样本的线粒体基因组,确定线粒体基因组序列信息。 |
申请公布号 |
CN105653899A |
申请公布日期 |
2016.06.08 |
申请号 |
CN201410642012.4 |
申请日期 |
2014.11.13 |
申请人 |
深圳华大基因研究院 |
发明人 |
周欣;唐敏;刘山林;苏旭;谭美华 |
分类号 |
G06F19/24(2011.01)I |
主分类号 |
G06F19/24(2011.01)I |
代理机构 |
北京清亦华知识产权代理事务所(普通合伙) 11201 |
代理人 |
李志东 |
主权项 |
一种同时确定多种样本的线粒体基因组序列信息的方法,所述多种样本所属种相互不同,其特征在于,包括以下步骤:提供所述多种样本中每一种的基因组DNA并混合,以便获得DNA混合物;将所述DNA混合物进行文库构建,以便获得DNA测序文库;对所述DNA测序文库进行测序,以便获得多个测序序列;将所述多个测序序列进行筛选,以便获得目标序列;将所述目标序列进行序列组装,以便获得多个组装序列;将所述多种样本中每一种进行形态学物种分类,以便获得多种样本的形态学物种分类信息;基于多种样本的形态学物种分类信息,参考线粒体蛋白基因数据库,将所述组装序列进行物种分配,以便确定多种样本中每一种的组装序列;以及基于所述多种样本中每一种的组装序列,分别构建各样本的线粒体基因组,确定线粒体基因组序列信息,任选地,所述线粒体蛋白基因数据库来自GenBank。 |
地址 |
518083 广东省深圳市盐田区北山工业区综合楼 |