发明名称 使用锌指核酸酶对Rosa位点进行基因组编辑
摘要 本文公开了使用融合蛋白质来对Rosa位点进行基因组编辑的方法以及组合物,所述融合蛋白质包含锌指蛋白和裂解功能域或裂解半功能域。本文还提供了编码所述融合蛋白质的多核苷酸,以及包含所述多核苷酸和融合蛋白质的细胞。
申请公布号 CN102939377B 申请公布日期 2016.06.08
申请号 CN201180020934.6 申请日期 2011.04.25
申请人 桑格摩生物科学股份有限公司;西格马奥利奇股份有限公司 发明人 X·崔;G·戴维斯;P·D·格雷戈里;M·C·霍姆斯;E·J·维因斯泰恩
分类号 C12N15/00(2006.01)I;C12N15/87(2006.01)I 主分类号 C12N15/00(2006.01)I
代理机构 上海专利商标事务所有限公司 31100 代理人 陶家蓉
主权项 一对融合蛋白质,包括第一和第二条融合蛋白质,每种融合蛋白质包含FokI核酸酶功能域和改造的锌指功能域,其中所述改造的锌指功能域结合大鼠Rosa内含子靶位点,所述Rosa内含子包含序列SEQ ID NO:75‑90,其中所述锌指功能域包含以F1‑F4、F1‑F5、或F1‑F6命名并从N端到C端排列的锌指DNA‑结合域,其中一对融合蛋白质中的至少一个锌指DNA‑结合域包含:RSANLTR(SEQ ID NO:42)或QNAHRKT(SEQ ID NO:22)或TSSNLSR(SEQ ID NO:71),所述包含识别区的锌指DNA‑结合域对选自下组:(i)融合蛋白质对中的第一种锌指功能域是F1:DRSDLSR(SEQ ID NO:38),F2:RSDDLTR(SEQ ID NO:39),F3:TSGHLSR(SEQ ID NO:40),F4:RSDNLSV(SEQ ID NO:41),和F5:RSANLTR(SEQ ID NO:42);和第二种锌指功能域是F1:QSDHLTK(SEQ ID NO:43),F2:NSSNLSR(SEQ ID NO:44),F3:RSDHLTK(SEQ ID NO:45),F4:NSDHLSR(SEQ ID NO:46),和F5:RSDHLSR(SEQ ID NO:47);(ii)融合蛋白质对中的第一种锌指功能域是F1:RSDHLSE(SEQ ID NO:48),F2:RSAALAR(SEQ ID NO:49),F3:RSDHLST(SEQ ID NO:50),F4:QNAHRIT(SEQ ID NO:51),和F5:RSAVLSE(SEQ ID NO:52);和第二种锌指功能域是F1:QSGDLTR(SEQ ID NO:17),F2:TSGSLTR(SEQ ID NO:18),F3:RSANLTR(SEQ ID NO:42),F4:RSDHLTK(SEQ ID NO:45),和F5:NSDHLSR(SEQ ID NO:46);(iii)融合蛋白质对中的第一种锌指功能域是F1:RSANLTR(SEQ ID NO:42),F2:QSGDLTR(SEQ ID NO:17),F3:QSGDLTR(SEQ ID NO:17),F4:RSANLAR(SEQ ID NO:53),和F5:RSDNLRE(SEQ ID NO:54);和第二种锌指功能域是F1:RSDHLST(SEQ ID NO:50),F2:DNRDRIK(SEQ ID NO:55),F3:RSDTLSE(SEQ ID NO:56),F4:QSSHLAR(SEQ ID NO:57),和F5:QNAHRKT(SEQ ID NO:22);(iv)融合蛋白质对中的第一种锌指功能域是F1:QSGDLTR(SEQ ID NO:17),F2:QSGDLTR(SEQ ID NO:17),F3:RSDNLTR(SEQ ID NO:58),F4:RSDNLSE(SEQ ID NO:21),和F5:QNAHRKT(SEQ ID NO:22);和第二种锌指功能域是F1:DRSDLSR(SEQ ID NO:38),F2:RSDHLST(SEQ ID NO:50),F3:DNRDRIK(SEQ ID NO:55),F4:RSDTLSE(SEQ ID NO:56),和F5:QSSHLAR(SEQ ID NO:57);(v)融合蛋白质对中的第一种锌指功能域是F1:QSGDLTR(SEQ ID NO:17),F2:RSDNLTR(SEQ ID NO:58),F3:RSDNLSE(SEQ ID NO:21),F4:QNAHRKT(SEQ ID NO:22),F5:RSDHLSE(SEQ ID NO:48),和F6:TSSTRKT(SEQ ID NO:59);和第二种锌指功能域是F1:TSGNLTR(SEQ ID NO:60),F2:QSGNLAR(SEQ ID NO:61),F3:RSDALSV(SEQ ID NO:62),F4:DSSHRTR(SEQ ID NO:63),和F5:RSDVLSE(SEQ ID NO:64);(vi)融合蛋白质对中的第一种锌指功能域是F1:RSDNLSE(SEQ ID NO:21),F2:QNAHRKT(SEQ ID NO:22),F3:RSDHLSE(SEQ ID NO:48),F4:TSSTRKT(SEQ ID NO:59),和F5:TSGHLSR(SEQ ID NO:40);和第二种锌指功能域是F1:TSGNLTR(SEQ ID NO:60),F2:QSGNLAR(SEQ ID NO:61),F3:RSDALSV(SEQ ID NO:62),和F4:DSSHRTR(SEQ ID NO:63);(vii)融合蛋白质对中的第一种锌指功能域是F1:QRSNLVR(SEQ ID NO:65),F2:RSDHLTQ(SEQ ID NO:66),F3:QSGHLQR(SEQ ID NO:67),和F4:DRSHLAR(SEQ ID NO:68);和第二种锌指功能域是F1:RSDVLSE(SEQ ID NO:64),F2:QRNHRTT(SEQ ID NO:69),F3:TKRSLIE(SEQ ID NO:70),F4:TSSNLSR(SEQ ID NO:71),F5:RSDDLSK(SEQ ID NO:25),和F6DNRDRIK(SEQ ID NO:55);(viii)融合蛋白质对中的第一种锌指功能域是F1:RSDHLSA(SEQ ID NO:72),F2:QSGHLSR(SEQ ID NO:24),F3:RSDHLSR(SEQ ID NO:47),F4:QNDNRIK(SEQ ID NO:73),和F5:QSGNLAR(SEQ ID NO:61);和第二种锌指功能域是F1:NNRDLIN(SEQ ID NO:74),F2:TSSNLSR(SEQ ID NO:71),F3:RSDVLSE(SEQ ID NO:64),F4:QRNHRTT(SEQ ID NO:69),F5:TKRSLIE(SEQ ID NO:70),F和6:TSSNLSR(SEQ ID NO:71)。
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