草木樨属18个物种植物条形码的目标条形码基因及其制备方法

摘要

本发明涉及一种鉴定草木樨属18个物种植物DNA条形码技术及其应用方法。挑选整合ITS、psbA-trnH、rbcL、matK、trnL这5个基因作为鉴定草木樨18个种的目标DNA条形码基因。基于ContigExpress的数据组织、编辑和分析法及ClustalW的多序列比对法，基于最小进化原理的Neighbor-Joining算法和no of difference方法构建聚类图，形成一种鉴定草木樨属18个物种植物DNA条形码技术的基本用法，确立标准分类条形码基因及对应序列。该技术建立了一种快捷、高效、准确率高的草木樨属不同物种DNA条形码鉴定方法，对草木樨属各物种的区分及种质资源的利用具有重要意义。

主权项

一种草木樨属18个物种植物条形码的目标条形码基因，其特征在于包括有：草木樨属植物物种鉴定，基于ITS基因的特异引物对，正向基因(5′‑3′)：GGAAGKARAAGTCGTAACAAGG；反向基因(5′‑3′)：RGTTTCTTTTCCTCCGCTTA；或草木樨属植物物种鉴定，基于psbA‑trnH基因的特异引物对，正向基因(5′‑3′)：GTTATGCATGAACGTAATGCTC；反向基因(5′‑3′)：CGCGCATGGTGGATTCACAAATC；或草木樨属植物物种鉴定，基于rbcL基因的特异引物对，正向基因(5′‑3′)；AGACCTWTTTGAAGAAGGTTCWGT；反向基因(5′‑3′)：TCGGTYAGAGCRGGCATRTGCCA；或草木樨属植物物种鉴定，基于matK基因的特异引物对，正向基因(5′‑3′)；CCCRTYCATCTGGAAATCTTGGTTC；反向基因(5′‑3′)：GCTRTRATAATGAGAAAGATTCTGC；或草木樨属植物物种鉴定，基于trnL基因的特异引物对，正向基因(5′‑3′)；CGAAATCGGTAGACGCTACG；反向基因(5′‑3′)：ATTTGAACTGGTGACACGAG。