发明名称 |
鉴别柑橘单胚和多胚的共显性InDel分子标记及其应用 |
摘要 |
本发明属于柑橘基因组学领域,本发明公开了一种鉴别柑橘单胚和多胚的共显性InDel分子标记及其应用,本发明通过对107个包括橘柚橙等材料的全基因组DNA的深度重测序,获得了全基因组序列信息,并通过比较筛选获得了单多胚候选区域内的基因序列信息,筛选出与表型关联性程度最高的序列,一个6bp的InDel序列。据此,开发了一套简单、快捷且共显性的PCR标记,通过引物对CK F/R、INS F/R及DEL F/R进行PCR扩增,得到了能够鉴别柑橘单多胚的共显性InDel分子标记。最后利用该标记在115个单株的自然群体以及100个单株的杂交群体对该位点进行了验证。该标记最大的优势在于低成本、准确率高,且可以柑橘苗期实现对胚性的早期选择。 |
申请公布号 |
CN105603096A |
申请公布日期 |
2016.05.25 |
申请号 |
CN201610105440.2 |
申请日期 |
2016.02.25 |
申请人 |
华中农业大学 |
发明人 |
徐强;王霞;徐远涛;邓秀新 |
分类号 |
C12Q1/68(2006.01)I;C12N15/11(2006.01)I;C12N15/10(2006.01)I |
主分类号 |
C12Q1/68(2006.01)I |
代理机构 |
武汉开元知识产权代理有限公司 42104 |
代理人 |
樊戎;冯超 |
主权项 |
一种鉴别柑橘单胚和多胚的共显性InDel分子标记,其特征在于:所述共显性InDel分子标记的核苷酸序列分别如SEQ ID NO:1、SEQ ID NO:2和SEQ ID NO:3所示。 |
地址 |
430070 湖北省武汉市洪山区狮子山街1号 |