发明名称 一种利用OPRK1基因的单核苷酸多态性检测绵羊规癖行为的方法及试剂
摘要 本发明属于生物检测技术领域,涉及一种利用OPRK1基因SNP检测绵羊规癖行为的方法及试剂。以PCR-SSCP技术为手段,发现了OPRK1基因在绵羊中的单核苷酸多态性T118A或G90A,并且该基因多态性和绵羊规癖行为性状相关,通过该检测,不需要长时间观测动物,不需要再进行必要分辅助治疗,即可尽早、尽快发现绵羊是否患有行为规癖,简单易行,降低了生产损失,提高了动物生产能力。
申请公布号 CN104120175B 申请公布日期 2016.05.11
申请号 CN201410245163.6 申请日期 2014.06.05
申请人 临沂大学 发明人 吕慎金
分类号 C12Q1/68(2006.01)I;C12N15/11(2006.01)I 主分类号 C12Q1/68(2006.01)I
代理机构 代理人
主权项 一种利用OPRK1基因的单核苷酸多态性检测绵羊规癖行为的方法,其特征在于:1)血样采集:绵羊后颈静脉采血5‑10 mL,置于内置1‑2.5 mL裂解液的15 mL指型管中,充分摇动至血细胞完全破裂,溶液呈粘稠状;2)引物准备:引物对采用如下的引物对1,SEQ ID NO.1‑2和引物对2,SEQ ID NO.3‑4,SEQ ID NO.1 TAACACAGCCTGCATCT;SEQ ID NO.2 TCCTGCCTACGTGAGGGA;SEQ ID NO.3 AGGACGGGGATGACGAAG;SEQ ID NO.4 ATCATCAACATCTGTAT;引物首先稀释为正常扩增的10倍浓度,‑20℃长期保存,使用时再稀释10倍;3)PCR扩增:PCR反应体系为20 μL,其中0.20 μL的5U/μL的Taq 酶, 2.20 μL含 Mg<sup>2+</sup> 的10×缓冲液, 1.20 μL 浓度为1μmol/L 引物, 1.20 μL 浓度为 2.0 mmol/L dNTPs, 1.40μL浓度为50 ng/L 的基因组 DNA,体系最后用去离子灭菌水补齐至 20μL;PCR反应程序如下:94℃预变性5 min, 然后94℃变性45 s, 54‑56℃退火40 s, 72℃延伸30 s,共33个循环;72℃延伸5 min, 产物4℃保存;4)基因组DNA提取结果确认:从绵羊血样中提取的基因组DNA溶于300 μL TE中,室温溶解24 h后用1.0%琼脂糖凝胶电泳检测,结果表明提取的基因组没有降解,长度在30 kb以上,所含DNA符合生物学试验要求;5)PCR扩增产物检测:对引物对1扩增产物进行SSCP分析,结果表现3种基因型,分别命名为AA、AB、BB;对引物对2扩增产物进行SSCP分析,结果表现3种基因型,分别命名为CC、CD、DD;6)OPRK1基因测序结果及同源性分析将引物对1所得AA、BB 2个基因型,引物对2所得CC、DD 两个基因型的克隆产物直接进行测序,并将引物对1所获得的一个杂合体AB型,其PCR产物纯化后直接进行双向测序;将测序结果与其他种属OPRK1基因cDNA序列进行比对,分析同源性,确定获得目的片段即为绵羊OPRK1序列;AA、BB 2个基因型在扩增片段DNA序列118bp处发生T→A突变,根据其在扩增片段上的位置,将该SNP位点命名为T118A;CC、DD 2个基因型在扩增片段DNA序列产物90bp处发生G→A的突变,将该SNP位点命名为G90A;对OPRK1基因SNP位点基因型与绵羊各行为性状进行最小二乘分析,分析上述来自引物对1和引物对2的各基因型对绵羊的修饰、观望、呆立行为的影响。
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