一种水稻孕穗期稳定表达的耐冷基因qCT-3-2^HHZ及其分子标记方法

摘要

一种水稻孕穗期稳定表达的耐冷基因qCT-3-2^HHZ及其分子标记方法，属于水稻高产抗逆育种和分子遗传学领域。根据连锁及连锁不平衡现象，利用“黄华占”与8个多样性丰富的供体亲本衍生的相互关联的育种群体，采用全基因组关联分析及物理作图方法，精细定位和验证孕穗期稳定性表达耐冷性基因qCT-3-2^HHZ，进一步开发基于普通PCR的实用经济型标记ZCT-7。将本发明应用于水稻耐冷害的辅助选择育种和聚合育种，能够有效的弥补以往自然变异基因的不足，不但可以显著降低利用初定位结果开展辅助育种带来的负面影响，而且可以在苗期对低世代的育种群体进行基因型选择，获得耐冷个体，便于及时的杂交转育，省去成株期低温抗性鉴定的过程，提高育种效率，加快育种进程。

主权项

一种水稻孕穗期稳定表达的耐冷基因qCT‑3‑2^HHZ，其特征在于：在水稻基因组第3染色体1823958‑2150858bp的区间内存在一个与孕穗期耐冷相关的一个基因位点qCT‑3‑2，优质籼稻品种“黄华占”在该位点上的等位基因能够显著增加水稻在孕穗期的耐冷性且为稳定性表达。