使用基于血液的样本的质谱的肺癌患者的治疗选择

摘要

用于预测与化学疗法相比、非小细胞肺部患者是否更可能获益于EGFR-I的测试使用对从患者所得到的基于血液的样本的质谱进行操作的计算机实现分类器。分类器利用训练集合，其包括来自作为被预测对EGFRI-I具有总生存有益效果的一类患者的成员的其它癌症患者、例如在美国专利7736905所述的测试下测试VS良好的那些患者的基于血液的样本的质谱数据。这个类标记编组进一步细分为两个子集，即，在癌症的治疗中的EGFR-I的投药之后呈现疾病的早期(类标签“早期”)和后期(类标签“后期”)进展的那些患者。

主权项

一种用于提前预测非小细胞肺癌(NSCLC)患者是否为与化学疗法相比、可能从采取上表皮生长因子受体抑制剂(EGFR‑I)的投药的形式的所述NSCLC的治疗得到更大有益效果的一类癌症患者的成员的方法，包括下列步骤：(a)在计算机可读介质中存储包括从通过基于血液的样本的质谱测定来确定为被预测为从癌症的治疗中的EGFR‑I得到总生存有益效果的一类患者的成员的多个癌症患者所得到的类标记质谱数据的训练集合，这类患者还分为两个子类：1.在癌症的治疗中投药所述EGFR‑I之后呈现疾病的早期进展的那些患者，这类患者的质谱数据具有“早期”或等效物的类标签；以及2.在癌症的治疗中投药EGFR‑I之后呈现疾病的后期进展的那些患者，这类患者的质谱数据具有类标签“后期”或等效物；(b)向质谱仪提供来自所述NSCLC患者的基于血液的样本，对所述基于血液的样本进行质谱测定，并且由此生成所述基于血液的样本的质谱；(c)借助于经编程计算机对于在步骤(b)所得到的所述质谱进行预定义预处理步骤；(d)在已经执行对步骤c)所述的所述质谱的所述预处理步骤之后得到在多个预定义m/z范围的所述质谱中的所选特征的累积强度特征值；以及(e)在所述经编程计算机中运行分类器，其包括用于将在步骤(d)所得到的所述累积强度值与在步骤(a)所存储的所述训练集合进行比较并且作为响应而生成所述基于血液的样本的类标签的分类算法，其中，如果在步骤(e)所生成的所述类标签对所述基于血液的样本的所述质谱是“后期”或等效物，则将所述患者识别为与癌症的治疗中的化学疗法相比、可能从所述EGFR‑I得到更大有益效果。