氨基酸距离多态性比较蛋白质序列进行物种分类的方法

摘要

本发明提出了一种氨基酸距离多态性比较蛋白质序列进行物种分类的方法，包括如下步骤：S10：对蛋白质序列上的每个氨基酸进行编号；S20：计算蛋白质序列上相邻同种氨基酸之间的距离；S30：统计相邻同种氨基酸的不同距离在每条蛋白质序列上出现的次数；S40：根据S30的统计数据进行两两序列对比，构建距离矩阵，根据距离矩阵计算产生系统发育树，进行物种分类。本方法将序列上氨基酸的差异转变为氨基酸之间距离的差异，既兼顾了空位，又无需插入间隔，方法简单，大大简化了计算量。

主权项

一种氨基酸距离多态性比较蛋白质序列进行物种分类的方法，其特征在于，包括如下步骤：S10：对蛋白质序列上的每个氨基酸进行编号；S20：计算蛋白质序列上相邻同种氨基酸之间的距离；S30：统计相邻同种氨基酸的不同距离在每条蛋白质序列上出现的次数；S40：根据统计的每种氨基酸的不同距离在每条蛋白质序列中出现的次数，进行两两对比，构建距离矩阵，根据距离矩阵计算产生系统发育树，进行物种分类。