发明名称 |
对血浆游离DNA进行多目标位点扩增建库的方法 |
摘要 |
本发明公开了一种对血浆游离DNA进行多目标位点扩增建库的方法,依次包括以下步骤:1)、末端修复和加A;2)、接头连接:在步骤1)所得的末端加A的DNA片段中加入已退火形成环状发夹结构的接头DNA,从而获得两侧结合上环状发夹接头后的双链DNA;当步骤1)中提取纯化的血浆游离DNA的量≤10ng时,进行步骤3);反之,当步骤1)中提取纯化的血浆游离DNA的量>10ng时,直接进行步骤4);3)、在步骤2)所得的加好接头的DNA中加入特异性引物I、Phi29酶和缓冲液,进行线性扩增;4)、PCR扩增:所述扩增产物构成游离DNA突变位点富集测序文库。 |
申请公布号 |
CN105442054A |
申请公布日期 |
2016.03.30 |
申请号 |
CN201511021881.6 |
申请日期 |
2015.12.30 |
申请人 |
杭州谷坤生物技术有限公司 |
发明人 |
金谷雷;牛耀芳 |
分类号 |
C40B50/06(2006.01)I |
主分类号 |
C40B50/06(2006.01)I |
代理机构 |
杭州中成专利事务所有限公司 33212 |
代理人 |
金祺 |
主权项 |
对血浆游离DNA进行多目标位点扩增建库的方法,其特征是依次包括以下步骤:1)、末端修复和加A:从而获得末端加A的DNA片段;2)、接头连接:包括在步骤1)所得的末端加A的DNA片段中加入已退火形成环状发夹结构的接头DNA,从而获得两侧结合上环状发夹接头后的双链DNA;所述环状发夹结构的接头DNA由环状接头序列、两侧互补序列构建而成;当步骤1)中提取纯化的血浆游离DNA的量≤10ng时,进行下述步骤3);反之,当步骤1)中提取纯化的血浆游离DNA的量>10ng时,直接进行下述步骤4);3)、在步骤2)所得的加好接头的DNA中加入特异性引物I、Phi29酶和缓冲液,在36.8~37.2℃进行线性扩增0.5~3小时;4)、PCR扩增:在步骤2)所得的连接接头后的DNA中或步骤3)所得的经过扩增的DNA中加入特异性引物II和通用引物以及带有index的测序接头引物P5和P7,进行14~30轮PCR循环扩增,获得扩增产物,所述扩增产物构成游离DNA突变位点富集测序文库。 |
地址 |
310052 浙江省杭州市滨江区建业路511号华业大厦4楼437室 |