Métodos, sistemas y software para la identificación de biomoléculas funcionales

摘要

Un método implementado por ordenador para predecir si las secuencias de polipéptidos objetivos hipotéticos se tienen o pueden tener al menos una propiedad funcional deseada, comprendiendo el método: (A) La identificación de uno o más motivos comunes a dos o más miembros de una población de secuencia de polipéptidos variantes usando un programa de ordenador, en el que las variantes de secuencia de polipéptido son variantes en el orden y la identidad de residuos de aminoácidos, en el que el motivo es un patrón de aminoácidos, y en el que un subconjunto de la población de secuencia de polipéptidos variantes comprende al menos una propiedad funcional deseada y un subconjunto de la población de secuencia de polipéptidos variantes carece de al menos una propiedad funcional deseada, para producir un conjunto de datos con motivos que comprende los motivos identificados en cada uno de los subgrupos de la población de variantes de secuencias de polipéptido; (B) La correlación de al menos un motivo a partir de los datos con motivos establecidos con el que al menos una propiedad funcional deseada para producir una función de puntuación de motivo, puntuando al menos un motivo de acuerdo con una frecuencia de ocurrencia en cada subconjunto de la población de secuencia de polipéptidos variantes o de acuerdo con a una frecuencia de ausencia de cada subconjunto de la población de la secuencia de polipéptido variantes , en el que la función de puntuación de motivo es capaz de predecir si las secuencias de polipéptidos objetivos hipotéticos se tienen o pueden tener la al menos una propiedad funcional deseada; y (C) La anotación de secuencias de polipéptidos objetivos hipotéticos, utilizando la función de puntuación de motivo para predecir si las secuencias hipotéticas de polipéptido de objetivo se tienen o pueden tener al menos una propiedad funcional deseada.