一种基于基因表达谱的药物毒性个体易感性基因标志物的筛选方法

摘要

本发明公开了一种基于基因表达谱的药物毒性个体易感性基因标志物的筛选方法，包括：根据个体对某药物毒性易感性的差异，挑选对药物毒性易感和耐受的个体分别组成易感亚集和耐受亚集；根据两个亚集给药前的基因表达谱，挑选给药前的差异表达基因；结合药物给药后两个亚集的基因表达谱，进一步筛选给药前的差异表达基因，筛选出能够指示所述某药物毒性的个体易感性的潜在基因标志物；对所述的潜在基因标志物进行验证，筛选得到能够指示所述某药物毒性的个体易感性的基因标志物。本发明基于基因表达谱研究药物毒性的个体易感性，方法可靠，可操作性强。

主权项

一种基于基因表达谱的药物毒性个体易感性基因标志物的筛选方法，其特征在于，包括：(1)根据个体对某药物毒性易感性的差异，在样本群体中选择对所述某药物毒性易感的个体组成易感亚集，选择对所述某药物毒性耐受的个体组成耐受亚集；步骤(1)中，根据给予某药物后，不同个体血清中与某药物毒性相关的生化指标的变化，判断个体对所述的某药物毒性为易感或耐受；所述易感亚集内个体的数量占样本群体的1/6～1/8，所述耐受亚集内个体的数量占样本群体的1/6～1/8；(2)分别取易感亚集和耐受亚集内个体给药前的体液或组织，提取RNA后通过芯片分析获得所述易感亚集和耐受亚集的基因表达谱，然后比较两个亚集的基因表达谱，筛选出易感亚集和耐受亚集表达具有显著差异的基因，即为给药前的差异表达基因；步骤(2)中，比较两个亚集的基因表达谱时，采用Welch t test对两个亚集的基因表达进行分析，选取p<0.05，且变化倍数FC≥2的基因作为给药前的差异表达基因；在采用Welch t test对两个亚集的基因表达进行分析前，对芯片数据进行提取和归一化处理，并剔除在所有芯片中强度都小于100的基因；(3)对所述的易感亚集和耐受亚集进行给药处理后，采集个体的体液或组织，提取RNA后通过芯片分析获得给药后易感亚集和耐受亚集的基因表达谱；(4)根据给药前后，易感亚集和耐受亚集的基因表达变化，将所述的给药前的差异表达基因分为两类：(ⅰ)(FC RA/R)*(FC SA/S)<0时，以︱FC RA/R︱*︱FC SA/S︱值的大小排序；(ⅱ)(FC RA/R)*(FC SA/S)>0时，以(FC RA/R)/(FC SA/S)值或(FC SA/S)/(FC RA/R)值的大小排序；其中，FC RA/R为给药前后耐受亚集单个基因的表达变化，FC SA/S为给药前后易感亚集单个基因的表达变化；排序后，以(ⅰ)和(ⅱ)中数值较大的基因作为能够指示所述某药物毒性的个体易感性的潜在基因标志物；(5)对所述的潜在基因标志物进行验证，筛选得到能够指示所述某药物毒性的个体易感性的基因标志物；所述的某药物为对乙酰氨基酚，毒性为肝脏毒性；所述的个体为鼠个体。