一种与植物根系性状相关的SNP位点及其应用

摘要

本发明公开了一种与植物根系性状相关的SNP位点及其应用。本发明的与植物根系性状相关的SNP位点，该SNP位点为SEQ ID No.4中自5’末端起第55位核苷酸，该第55bp位核苷酸为C和/或G；SEQ ID No.4所示DNA片段在小麦染色体1BS上的19.3cM位置。本发明提供了一个新根系主效基因位点QRt.caas-1BS及该位点的辅助筛选优良根系小麦的SNP位点。利用该SNP位点可以筛选根系性状优良的小麦，在小麦根系相关育种中发挥重要作用。

主权项

一种鉴别优良根系植物的方法，如下(1)或(2)：(1)利用特异引物组或PCR试剂盒对待测植物进行PCR扩增，对PCR扩增产物进行测序；若测序结果只有一种，为SEQ ID No.4，且自其5’末端起第55位为C，则确定待测植物的SNP位点的基因型为CC；若测序结果同时有两种，分别为SEQ ID No.4和SEQ ID No.5，且自SEQ ID No.45’末端起第55位为C或G，则确定待测植物的SNP位点的基因型为CG或GG；基因型为CC的植物的根系优于基因型为CG或GG的植物；(2)利用特异引物组或PCR试剂盒，对待测植物进行PCR扩增，对PCR扩增产物进行凝胶电泳；若电泳显示扩增产物为173bp的一种片段，则确定待测植物的SNP位点的基因型为CC；若电泳显示扩增产物为173bp和138bp的两种片段，则确定待测植物的SNP位点的基因型为CG或GG；基因型为CC的植物的根系优于基因型为CG或GG的植物；所述植物为小麦；所述特异引物组包括三条引物，第一条引物的核苷酸序列如SEQ ID No.1所示，第二条引物的核苷酸序列如SEQ ID No.2所示；第三条引物的核苷酸序列如SEQ ID No.3所示；所述PCR试剂盒包括所述特异引物组和PCR扩增缓冲液。