从含有少量靶标DNA的样品富集DNA测序文库

摘要

本文提供了用于在溶液中捕获DNA分子的方法。该方法可以包括：从包含内源性DNA和环境DNA的样品提取DNA以产生提取的DNA；将通用衔接子连接至所提取的DNA；在溶液中将所提取的DNA与亲和标记的RNA探针杂交，所述亲和标记的RNA探针由以下步骤产生：在亲和标记的核糖核苷酸的存在下，体外转录已被连接至RNA启动子衔接子的片段化的参考基因组DNA的文库；在与衔接子互补的RNA寡核苷酸的存在下，将产物与系到基底的捕获剂结合，从而将杂交的DNA分子捕获在基底上；洗涤基底以去除任何未结合的DNA分子；以及释放所捕获的DNA分子。还提供了用于执行该方法的试剂盒。

主权项

用于在溶液中捕获DNA分子的方法，其包括：a)从包含内源性DNA和环境DNA的样品提取DNA以产生提取的DNA，其中所提取的DNA包含比内源性DNA更多的环境DNA；b)将通用衔接子连接至所提取的DNA；c)在溶液中将所提取的DNA与亲和标记的RNA探针杂交，所述亲和标记的RNA探针由以下步骤产生：在亲和标记的核糖核苷酸的存在下，体外转录已被连接至RNA启动子衔接子的片段化的参考基因组DNA的文库；d)在与所述通用衔接子的一条链或多条链互补或与所述通用衔接子的一条链或多条链具有相同序列的RNA寡核苷酸的存在下，将步骤c)的产物与系到基底的捕获剂结合，从而将杂交的DNA分子捕获在所述基底上；e)洗涤所述基底以去除任何未结合的DNA分子；以及f)释放所捕获的DNA分子。