猪5号染色体上一个与产仔数相关的分子标记及其引物

摘要

本发明涉及与猪产仔数性状相关的分子标记，具体涉及猪5号染色体上一个与产仔数相关的分子标记及其引物，属生物技术领域。该分子标记位点为基因组版本NCBI Build Sscrofa10.2的Chr5:32275545；该位点的等位基因为T和C，有C/C、T/C和T/T三种基因型，该位点及其侧翼序列如SEQ ID NO:1所示。扩增权利要求1所述分子标记位点的引物及延伸引物为：Chr5-PCRU：5’-TGC TGA AGA GAG GAT TTC ACA-3’；Chr5-PCRL：5’-AAG AAG ATG CTT CAC TAC CAG C-3’；Chr5-SNPU：5’-CTG ACT GAC TAA GGG TAT GTG GAG CTA AGA CAC AT-3’。带有T/T基因型的猪产仔数高于T/C和C/C基因型。本发明的有益效果在于：运用全基因组重测序方法，能够快速、批量地筛选与性状相关的分子标记或候选基因，Chr5:32275545这个位点能够作为遗传标记用于猪的遗传育种提高母猪的产仔数。

主权项

一种检测猪5号染色体上一个与产仔数相关的分子标记中SNP位点的引物，其特征在于：所述引物包括PCR扩增引物以及延伸引物，其中PCR扩增引物的核苷酸序列如下所示：Chr5‑PCRU：5’‑TGC TGA AGA GAG GAT TTC ACA‑3’；Chr5‑PCRL：5’‑AAG AAG ATG CTT CAC TAC CAG C‑3’；延伸引物的核苷酸序列如下所示：Chr5‑SNPU：5’‑CTG ACT GAC TAA GGG TAT GTG GAG CTA AGA CAC AT‑3’，所述猪为白色杜洛克×二花脸猪杂交资源群F2代母猪，所述SNP位点为基因组版本NCBI Sscrofal10.2的Chr5:32275545,该位点的等位基因为T和C，有C/C、T/C和T/T三种基因型，带有T/T基因型的猪产仔数高于带有T/C和C/C基因型的猪，其中等位基因T为提高猪产仔数的有益等位基因。