用于孔石莼LAMP-LFD检测的引物和探针序列

摘要

本发明公开了用于孔石莼LAMP-LFD检测的引物和探针序列，特点是根据基因库登录号为HQ902008的孔石莼内转录间隔区序列的编码序列设计LAMP的三对引物序列和一条探针序列，引物的核苷酸序列如SEQ ID NO.1-6所示，探针的核苷酸序列如SEQ ID NO.7所示，利用上述的引物和探针，通过LAMP反应体系扩增步骤，探针杂交LAMP反应产物步骤，使用LFD检测步骤实现孔石莼的检测，优点是检测速度快，检测成本低，检测灵敏度和准确性高。

主权项

一种用于孔石莼LAMP‑LFD检测的引物和探针序列，其特征在于根据基因库登录号为HQ902008的孔石莼内转录间隔区序列的编码序列设计LAMP的三对引物序列和一条探针序列，引物序列具体如下：UpeITS‑F3：5’‑ TAGCCTCACCTGAACTCAG‑3’UpeITS‑B3：5’‑ ACGGATATCTCGGCTCTC‑3’，UpeITS‑FIP：5’‑ CGGCTGAAATACAGAGGCTCGTATCCTTCGTGGCTCACA‑3’，UpeITS‑BIP：5’‑ GTTATTCCGACGCTGAGGCAGCAGAATTCCGTGAGTCAT‑3’，UpeITS‑LF：5’‑ TAGGTAGCTCGCTACTCCTAC‑3’，UpeITS‑LB：5’‑ GTGGTCTCATCCGAAGACTC‑3’， UpeITS‑FIP的5’端为生物素标记；探针序列如下：UpeITS‑HP：5’‑GCAAGCGCGTGAGGGGTTAT‑3’，5’端为异硫氰酸荧光素标记。