一种基于模式分析研究中药物质基础和作用机制的方法

摘要

本发明涉及中药分析技术领域，具体公开了一种基于模式分析研究中药物质基础和作用机制的方法。所述的方法包含如下步骤：S1.构建中药成分网络；S2.构建成分－靶点网络；S3.构建靶点相互作用网络；S4.构建二阶异质网络；S5.检测并分析关键网络。利用该方法分析复方丹参滴丸治疗颈动脉粥样硬化的物质基础和作用机制，结果分析得出4个主要成分，9个关键网络，进一步分析网络的结果初步揭示了复方丹参滴丸治疗颈动脉粥样硬化的物质基础和作用机制，结果得到研究报道的验证。

主权项

一种基于模式分析研究中药物质基础和作用机制的方法，其特征在于，包含如下步骤：S1.构建中药成分网络：从现有报道中收集待研究的中药的化学成分及所述化学成分的结构，用PaDEL‑Descriptor计算化学成分的pubchem fingerprint，然后自编程序计算Tanimoto系数；将Tanimoto系数大于0.90的，定义为非常相似的结构，从而获得中药化学成分之间的关系，构建中药成分网络；S2.构建成分－靶点网络：在数据库中收集S1.中收集的化学成分的靶点；将有三个或以上的化学成分同时作用的靶点，定义为有效靶点，构建成分－靶点网络；S3.构建靶点相互作用网络：将S1.和S2.中收集得到的化学成分及靶点通过MATLAB自编程序对数据库UniHI信息进行筛选，构建靶点相互作用网络；S4.构建二阶异质网络：以成分‑靶点作用网络为基础，应用Cytoscape构建二阶异质网络；S5.检测并分析关键网络：采用Cytoscape中clusterMaker插件，用Girvan‑Newman算法对异质网络进行网络结构分析，通过计算各模块的Modularity measure和Ratio of preserved CPIs筛选关键模块，最后对其中的药理单位进行GO注释和KEGG通路分析，从而确定中药在治疗疾病过程中可能的有效成分、作用靶点和通路。