大熊猫抗细菌潜力检测的II类MHC基因的特异性引物及分型方法

摘要

本发明公开了大熊猫抗细菌潜力检测的II类MHC基因的特异性引物及分型方法。引物序列如序列表所示，大熊猫II类MHC区域DRA、DRB3、DQA1、DQA2、DQB1和DQB2基因二号外显子的分型方法是采用所述的扩增产物，用单链构象多态性对目标片断进行基因分型。II类MHC负责结合及呈递细菌抗原，从而激发相应免疫反应，本发明有利于正确进行大熊猫II类MHC基因分型和基因多态性分析，因此能帮助我们进一步研究与细菌引起的疾病有关的特定等位基因、评估大熊猫抗病能力以及更好地进行大熊猫保护育种。

主权项

用于扩增大熊猫II类MHC区域DRA、DRB3、DQA1、DQA2、DQB1和DQB2基因二号外显子的特异性引物组，其特征在于包括十对引物，引物对的核苷酸序列如下所示：引物对一：上游引物DRAF：GTCTCACATCCCGGGTTCTTCTT；下游引物DRAdn：TTTCAAAGTTAGGATTCCCGTGTCT；引物对二：上游引物RAF:TTCCTCTCCCCCTCCTGGTTCC；下游引物RAR:TAGGATTCCCGTGTCTAGGAGTGC；引物对三：上游引物DRB1F2：GAGCCCGCGGGTGAGCGGATC；下游引物RB13dn4：CCACACAGTCCCTGACGTCT；引物对四：上游引物DRB1F3:AGCGGATCGTCTCTGTCCCCA；下游引物RB13dn3:CCCTGTATGTTCACTCCGGATGT；引物对五：上游引物DQA1up3:CTGTCACTTGGTTTAGTAATACTCT；下游引物DQA1dn1:CATTGGTAGCAGCGGTATAGTTGGA；引物对六：上游引物DQA2up1:GTTTCTTCCGTCACTTGGCTTAATAAG；下游引物DQA2dn1:AGGCAGAGCATTGGACACATACCAT；引物对七：上游引物DQB1F1:TTTTACTGAGTCCTCAAGCTCA；下游引物DQBdn:GCGCGAACGGCCTGGCTCAC；引物对八：上游引物DQBup1:AGTGACCCGCGGTGATTCCC；下游引物DQBdn:GCGCGAACGGCCTGGCTCAC；引物对九：上游引物DQB2F1:TTGTTTTACTCAGTTATCAGACTGG；下游引物DQB2dn:GAGGCGGAAGGGGGCGCCGCG；引物对十：上游引物DQBup3:GTAGTGCTGCACAAGGACTGCC；下游引物DQB2dn:GAGGCGGAAGGGGGCGCCGCG；引物对一、引物对二扩增DRA，其中引物对一为巢式PCR外侧引物，引物对二是巢式PCR内侧引物；引物对三、引物对四扩增DRB3，其中引物对三为巢式PCR外侧引物，引物对四是巢式PCR内侧引物；引物对五扩增DQA1；引物对六扩增DQA2；引物对七、引物对八扩增DQB1，其中引物对七为巢式PCR外侧引物，引物对八是巢式PCR内侧引物；引物对九、引物对十扩增DQB2，其中引物对九为巢式PCR外侧引物，引物对十为巢式PCR内侧引物。