发明名称 一种用Pax7基因检测牛体尺体重的方法
摘要 本发明公开了一种用Pax7基因检测牛体尺体重的方法,包括牛血液基因组提取、引物设计、PCR反应、PCR-SSCP分析和统计模型建立,采用PCR-SSCP技术结合DNA测序检测牛Pax7基因变异位点,PCR-SSCP分析结果显示三种带型,测序后发现Pax7基因g.103976G>C突变位点,三种带型分别被命名为CC、CG和GG型,该突变位点位于Pax7基因外显子9,在牛群中进行分型统计及其与体尺性状的关联分析,发现GG型和CG型的体高和体斜长极显著高于CC型;GG型和CG型的体重显著高于CC型;在胸围、管围和坐骨端宽方面差异不显著。本发明操作简单、费用低、精确度高、可快速检测牛体尺体重。
申请公布号 CN105274247A 申请公布日期 2016.01.27
申请号 CN201510822649.6 申请日期 2015.11.23
申请人 安徽农业大学 发明人 刘洪瑜;王恒;王力生;韩春杨;林珊
分类号 C12Q1/68(2006.01)I 主分类号 C12Q1/68(2006.01)I
代理机构 北京轻创知识产权代理有限公司 11212 代理人 沈尚林
主权项 一种用Pax7基因检测牛体尺体重的方法,包括牛血液基因组提取、引物设计、PCR反应、PCR‑SSCP分析和统计模型建立,其特征在于,具体包括以下步骤:(1)牛血液基因组提取:苯酚‑氯仿提取法提取牛全基因组DNA后利用TE缓冲溶液溶解DNA,采用超微量紫外分光光度计检测DNA浓度,最后稀释至50ng/μL,存于‑20℃备用;(2)引物设计:根据牛Pax7基因序列设计一对引物Pax7‑9上游引物和Pax7‑9下游引物,其中:Pax7‑9上游引物:5'‑AGCCTCCCATCCTCAGTC‑3';Pax7‑9下游引物:5'‑GGACCTCATCCCAGACAGC‑3';(3)PCR反应:利用步骤(2)中设计的引物对全基因组DNA进行PCR扩增,获得牛Pax7基因位于外显子9的309bp片段,此区域为该基因的编码区;(4)PCR‑SSCP分析:扩增片段变性后,采用10%的聚丙烯酰胺凝胶电泳后进行银染和显色;SSCP分析后,纯化不同带型个体的PCR产物,分为三种基因型,测序后发现Pax7基因g.103976G>C突变位点,三种带型分别被命名为CC、CG和GG型,该突变位点位于Pax7基因外显子9;(5)统计模型建立:根据牛群特点,建立固定模型,运用SPSS软件对数据进行分析,将碱基突变位点与牛体型体重性状进行关联分析,结果显示GG型和CG型的体高和体斜长极显著高于CC型;GG型和CG型的体重显著高于CC型;在胸围、管围和坐骨端宽方面差异不显著。
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